Inhibiteurs DUB3

Les inhibiteurs DUB3 courants comprennent, entre autres, l'actinomycine D CAS 50-76-0, l'α-amanitine CAS 23109-05-9, la doxorubicine CAS 23214-92-8, la 5-azacytidine CAS 320-67-2 et la mithramycine A CAS 18378-89-7.

Les inhibiteurs de DUB3 désignent une classe de composés chimiques spécifiquement conçus pour cibler et inhiber l'activité de l'enzyme de déubiquitination connue sous le nom de DUB3, également appelée USP17 (ubiquitin-specific peptidase 17) ou USP17L2. Les enzymes de désubiquitination (DUB) jouent un rôle essentiel dans le processus d'ubiquitination, qui est une modification post-traductionnelle par laquelle les protéines ubiquitine sont attachées à une protéine substrat, la marquant pour la dégradation ou modifiant sa localisation ou son activité cellulaire. Les DUB, comme DUB3, inversent ce processus en retirant les molécules d'ubiquitine des substrats, régulant ainsi la protéostase et d'autres voies de signalisation cellulaires. Ainsi, les inhibiteurs de DUB3 se lient aux sites actifs de cette enzyme, ce qui peut affecter son activité catalytique. L'inhibition de DUB3 affecterait l'équilibre de l'ubiquitination et de la désubiquitination dans les cellules, ce qui pourrait avoir divers effets en aval sur les fonctions cellulaires et les voies de signalisation.

Le développement d'inhibiteurs de DUB3 commencerait par la compréhension de la structure et de la fonction de l'enzyme. Des outils de biologie structurale tels que la cristallographie aux rayons X, la résonance magnétique nucléaire (RMN) et la cryo-microscopie électronique pourraient être utilisés pour déterminer la structure tridimensionnelle de DUB3. Grâce à ces informations structurelles, les scientifiques peuvent identifier les sites actifs et les sites allostériques potentiels qui sont cruciaux pour l'activité de déubiquitinisation de l'enzyme. Des méthodes de criblage à haut débit pourraient alors être employées pour rechercher des petites molécules qui présentent une affinité de liaison avec ces sites sur DUB3. Ces premiers résultats seraient ensuite validés par divers essais in vitro conçus pour mesurer les effets inhibiteurs des composés sur l'activité enzymatique de DUB3. Par exemple, les tests utilisant la fluorescence ou l'électrochimiluminescence peuvent détecter la libération de l'ubiquitine des protéines substrats, indiquant ainsi l'efficacité des inhibiteurs.