Inhibiteurs DDX19B

Les inhibiteurs courants de la DDX19B comprennent, sans s'y limiter, la Novobiocine CAS 303-81-1, l'acide aurintricarboxylique CAS 4431-00-9, le bromure d'éthidium CAS 1239-45-8, la berbérine CAS 2086-83-1 et le chlorhydrate d'amsacrine CAS 54301-15-4.

Les inhibiteurs chimiques de DDX19B ciblent les fonctions essentielles de la protéine, telles que l'hydrolyse de l'ATP et la liaison à l'ARN, qui sont indispensables à son activité d'hélicase impliquée dans le transport nucléocytoplasmique de l'ARN. La novobiocine remplit une fonction similaire en se liant au domaine ATPase de la DDX19B, empêchant ainsi les changements de conformation nécessaires à sa fonction d'hélicase de l'ARN. L'acide aurintricarboxylique inhibe la DDX19B en entravant l'interaction entre la protéine et l'ARN, car il se lie aux sites de liaison de l'acide nucléique de la DDX19B, ce qui empêche la protéine de remplir sa fonction de désenroulement de l'ARN. L'interférence avec les structures des acides nucléiques est une autre stratégie employée par les inhibiteurs tels que le bromure d'éthidium et la berbérine; ces composés s'intercalent avec les acides nucléiques, modifiant leur structure et inhibant ainsi la capacité de DDX19B à lier ou à dérouler son substrat.

D'autres substances chimiques, comme l'Amsacrine et la Mitoxantrone, perturbent la fonction de DDX19B par des moyens similaires. En s'insérant dans l'ADN, ils créent une structure d'acide nucléique déformée avec laquelle DDX19B ne peut pas s'engager efficacement, entravant ainsi son action d'hélicase. L'actinomycine D se lie à l'ADN et entrave la synthèse de l'ARN dépendant de l'ADN, ce qui entraîne l'inhibition de DDX19B par encombrement stérique, empêchant la protéine d'interagir avec son substrat ARN. La suramine et l'héparine inhibent DDX19B par un mécanisme différent; elles se lient à la protéine et entravent son interaction avec les substrats d'ARN, ce qui est essentiel pour son activité d'hélicase. L'oxaliplatine forme des adduits et des liaisons croisées avec l'ADN qui ne sont pas facilement dénoués par la DDX19B, ce qui entraîne l'inhibition de l'activité hélicase de la protéine. Enfin, la Daunorubicine, par son intercalation dans l'ADN, empêche le déroulement de la DDX19B, inhibant ainsi le rôle de la protéine dans le transport nucléocytoplasmique de l'ARN.