Les inhibiteurs tels que la staurosporine et l'U0126 agissent en entravant l'activité des kinases, qui sont cruciales pour la phosphorylation et l'activation de nombreuses protéines impliquées dans les voies de signalisation. Des composés tels que le LY294002 et la wortmannine ciblent des kinases spécifiques de la voie PI3K/AKT/mTOR, un conduit central pour les signaux qui régulent la croissance, la prolifération et la survie des cellules. Ces inhibiteurs peuvent moduler l'activité des protéines qui sont régulées par des événements de phosphorylation et de déphosphorylation.
De même, la rapamycine et ses analogues inhibent la voie mTOR, qui est profondément intégrée à la synthèse des protéines et à l'autophagie, affectant ainsi un large éventail de fonctions cellulaires. La brefdine A et le cycloheximide, quant à eux, perturbent des processus cellulaires fondamentaux tels que le transport et la synthèse des protéines, respectivement, ce qui a un impact sur la fonction protéique à grande échelle. Des composés tels que le 2-Deoxy-D-glucose interfèrent avec les voies de production d'énergie telles que la glycolyse, ce qui pourrait avoir un impact sur les protéines dont l'activité nécessite de l'ATP. Le MG132 inhibe le système ubiquitine-protéasome, entraînant l'accumulation de protéines qui sont habituellement ciblées pour la dégradation, ce qui pourrait affecter le renouvellement et la fonction des protéines.
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