Le facteur de croissance épidermique (EGF) déclenche la cascade de signalisation du récepteur de l'EGF, qui aboutit à une série d'événements de phosphorylation susceptibles d'améliorer l'activité d'une multitude de protéines. De même, le phorbol 12-myristate 13-acétate (PMA), en activant la protéine kinase C (PKC), déclenche un réseau de phosphorylations qui peut influencer les protéines, façonner leur fonction et leur comportement au sein de la cellule. L'insuline, avec sa capacité à interagir avec son récepteur spécifique, déclenche un relais de signalisation qui peut intensifier la synthèse et l'activité des protéines, démontrant la relation complexe entre les signaux externes et la machinerie protéique cellulaire. L'ionomycine, en augmentant la concentration intracellulaire de calcium, peut activer les protéines de signalisation dépendantes du calcium, ce qui montre l'importance des concentrations d'ions dans la régulation des protéines.
L'orthovanadate de sodium, en tant qu'inhibiteur puissant des protéines tyrosine phosphatases, garantit que les protéines restent phosphorylées sur les résidus tyrosine, ce qui peut affecter leur activité et leurs interactions. L'isoprotérénol, en stimulant les récepteurs bêta-adrénergiques, augmente les niveaux intracellulaires d'AMPc, qui à leur tour activent la PKA, entraînant des effets étendus sur la phosphorylation des protéines. L'anisomycine, bien qu'étant principalement un inhibiteur de la synthèse des protéines, peut également activer les protéines kinases activées par le stress, qui peuvent moduler l'activité des protéines, ce qui illustre la double nature de certains activateurs chimiques. L'IBMX, en inhibant les phosphodiestérases, augmente les niveaux d'AMPc, influençant indirectement l'activité de la PKA et donc les schémas de phosphorylation des protéines. La tunicamycine et la chloroquine influencent toutes deux la maturation et la stabilité des protéines, bien que par des mécanismes différents - la première en inhibant la glycosylation et la seconde en modifiant le pH endosomal. Le MG132, en inhibant le protéasome, empêche la dégradation des protéines, augmentant indirectement les niveaux de certaines protéines. L'A23187, un ionophore calcique, facilite l'afflux de calcium, activant les voies de signalisation des protéines dépendantes du calcium.
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