Les inhibiteurs chimiques de C12orf42 peuvent orchestrer l'inhibition fonctionnelle par diverses voies biochimiques. La staurosporine, par exemple, cible les protéines kinases qui sont indispensables à l'activation de C12orf42, entravant ainsi sa fonction. De même, la génistéine agit en inhibant les tyrosines kinases, qui sont probablement impliquées dans les processus de phosphorylation essentiels à l'activité de C12orf42. En bloquant ces kinases, la génistéine s'assure que la phosphorylation nécessaire à l'activité de la protéine est entravée. Le LY294002 et la Wortmannine, tous deux inhibiteurs de PI3K, perturbent la voie PI3K/AKT, qui est une voie de signalisation qui, si elle est nécessaire à la signalisation de C12orf42, sera gravement altérée par ces inhibiteurs. Les inhibiteurs de la MEK PD98059 et U0126 contribuent également à l'inhibition en ciblant les kinases en amont qui devraient normalement phosphoryler les substrats du C12orf42 ou l'activer directement, entraînant ainsi un effet en aval de l'inhibition fonctionnelle.
Poursuivant le thème de l'inhibition des voies, la rapamycine inhibe mTOR, un composant d'une cascade de signalisation qui peut être crucial pour l'état fonctionnel de C12orf42. SP600125 et SB203580 provoquent une inhibition en ciblant respectivement JNK et p38 MAP kinase, ce qui peut empêcher l'activation de facteurs de transcription et de cibles en aval impliqués dans C12orf42. Le dasatinib et le PP2, qui sont tous deux des inhibiteurs de tyrosine kinase, bloquent les voies de signalisation qui conduiraient autrement à l'activation de C12orf42. Le dasatinib a un large spectre d'activité, tandis que PP2 inhibe spécifiquement la famille Src des tyrosines kinases, ce qui indique une approche plus ciblée pour perturber les cascades de signalisation pertinentes. Enfin, PD173074 inhibe le FGFR qui, faisant partie d'une voie de signalisation, est essentiel à la fonction de C12orf42, ce qui garantit que toute activation de la protéine dépendant du FGFR est effectivement réduite. Grâce à l'action concertée de ces inhibiteurs chimiques, l'activité fonctionnelle de C12orf42 est directement et efficacement diminuée.
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