Les inhibiteurs chimiques de la BKS peuvent perturber ses fonctions de signalisation par le biais de divers mécanismes moléculaires. La wortmannine et le LY294002, par exemple, ciblent les phosphoinositide 3-kinases (PI3K), enzymes clés de la voie de signalisation PI3K/Akt qui est souvent cruciale pour les fonctions protéiques liées à la survie, à la prolifération et au métabolisme des cellules. En inhibant la PI3K, ces produits chimiques empêchent la phosphorylation du phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate (PIP2) en phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate (PIP3). Cette inhibition peut empêcher l'activation des cibles en aval sur lesquelles ou avec lesquelles la BKS peut agir, entravant ainsi la fonctionnalité de la BKS dans la signalisation cellulaire. De même, les inhibiteurs de kinases spécifiques tels que le Dasatinib et le PP2 interfèrent avec les kinases de la famille Src. Les kinases Src étant impliquées dans diverses voies de signalisation, leur inhibition par ces produits chimiques peut perturber l'activité fonctionnelle de la BKS si elle est associée à des voies de signalisation médiées par Src.
D'autres effets inhibiteurs sur la BKS proviennent de produits chimiques tels que U0126, PD98059, SB203580 et SP600125, qui ciblent différentes protéines kinases activées par les mitogènes (MAPK). L'U0126 et le PD98059 inhibent spécifiquement la MEK1/2, bloquant ainsi l'activation des kinases régulées par le signal extracellulaire (ERK), ce qui pourrait être nécessaire au rôle de la BKS dans certaines voies de signalisation. Le SB203580, quant à lui, inhibe la MAPK p38 et le SP600125 inhibe la kinase c-Jun N-terminale (JNK), qui font toutes deux partie de la famille des MAPK. Ces inhibiteurs peuvent perturber la cascade de signalisation MAPK, entraînant une diminution de l'activité de la BKS si elle est régulée par la MAPK. En outre, le GF109203X et le Go6983, en tant qu'inhibiteurs de la protéine kinase C (PKC), peuvent entraver les voies de signalisation où la fonctionnalité de la BKS dépend de la phosphorylation médiée par la PKC. Enfin, les inhibiteurs de mTOR comme la rapamycine et l'AZD8055 peuvent avoir un effet substantiel sur la BKS en bloquant la voie mTOR, qui est essentielle à la croissance et à la prolifération des cellules. L'AZD8055 cible spécifiquement les complexes mTORC1 et mTORC2, qui pourraient être essentiels à l'activité de la BKS dans les réseaux de signalisation connexes. Chacun de ces produits chimiques, en ciblant des kinases ou des voies de signalisation spécifiques, peut modifier de manière significative le paysage fonctionnel dans lequel BKS opère au sein de la cellule.
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