Apoptosis Inducing Factor Mitochondria Associated 3 (AIFM3) serait un membre de la famille des facteurs d'induction de l'apoptose (AIF) caractérisé par son rôle dans la voie intrinsèque de l'apoptose. Les membres de la famille AIF sont généralement des flavoprotéines mitochondriales qui, sous l'effet de stimuli apoptotiques, transitent des mitochondries vers le noyau pour faciliter la condensation de la chromatine et la fragmentation de l'ADN, caractéristiques de la mort cellulaire programmée.
L'AIFM3, si elle existait, partagerait probablement des domaines structurels avec d'autres protéines AIF, tels qu'un domaine de liaison à la flavine adénine dinucléotide (FAD), qui est essentiel pour leur activité d'oxydoréductase, et un domaine C-terminal qui pourrait servir de médiateur pour sa liaison à l'ADN et à la chromatine. La protéine pourrait participer aux réactions d'oxydoréduction dans les mitochondries dans des conditions physiologiques normales, contribuant ainsi au maintien de l'homéostasie de l'oxydoréduction dans la cellule. Cette libération pourrait être médiée par la perméabilisation de la membrane externe de la mitochondrie, un processus souvent régulé par les membres pro-apoptotiques de la famille Bcl-2. Dans le noyau, l'AIFM3 induirait la fragmentation de l'ADN, soit par une activité nucléasique directe, soit en recrutant d'autres enzymes dégradant l'ADN, ce qui conduirait au désassemblage contrôlé de la cellule.
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