Les activateurs du gène A030007L17Rik représentent une classe de composés chimiques qui peuvent renforcer l'activité du gène A030007L17Rik. L'étape initiale de l'identification de ces activateurs implique un criblage à haut débit (HTS). Cette approche est essentielle pour passer au crible de grandes bibliothèques de produits chimiques afin d'identifier ceux qui ont l'effet désiré sur l'activité du gène. Plus précisément, dans ce contexte, un essai de gène rapporteur est mis en place dans lequel le promoteur A030007L17Rik contrôle l'expression d'un gène rapporteur détectable. Le gène rapporteur code généralement pour une protéine capable de générer un signal mesurable, tel que la fluorescence ou la luminescence, lors de l'activation. Lorsque divers composés chimiques sont introduits dans ce système, ceux qui peuvent augmenter l'activité du promoteur produiront un signal plus élevé. Les composés qui produisent une augmentation significative de l'activité du rapporteur sont identifiés comme des activateurs potentiels du gène A030007L17Rik. Ces molécules candidates font l'objet d'études de confirmation supplémentaires afin de valider leur potentiel d'activation du gène.
Une fois que le criblage à haut débit a permis d'identifier les composés prometteurs, l'étape suivante consiste à les valider à l'aide de la PCR quantitative (qPCR). Cette technique permet de quantifier avec précision les niveaux d'expression de l'ARNm du gène A030007L17Rik en présence des activateurs chimiques. Une augmentation des niveaux d'ARNm suggère que le produit chimique peut activer le gène au niveau transcriptionnel. Pour s'assurer que cette augmentation de l'ARNm se traduit par une augmentation correspondante de l'expression des protéines, une analyse par Western blot est ensuite réalisée. Il s'agit de résoudre les protéines cellulaires par électrophorèse sur gel, de les transférer sur une membrane, puis de les sonder avec des anticorps spécifiques de la protéine A030007L17Rik. Une augmentation visible des niveaux de protéines détectés, par rapport aux témoins non traités, confirmerait l'efficacité du composé dans l'activation du gène, indiquant une régulation positive du produit protéique. L'ensemble de ces méthodes fournit une confirmation solide du rôle du produit chimique en tant qu'activateur, établissant un lien direct entre l'activation du gène observée au niveau de l'ARNm et la production finale de la protéine.
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Nom du produit | CAS # | Ref. Catalogue | Quantité | Prix HT | CITATIONS | Classement |
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PMA | 16561-29-8 | sc-3576 sc-3576A sc-3576B sc-3576C sc-3576D | 1 mg 5 mg 10 mg 25 mg 100 mg | $40.00 $129.00 $210.00 $490.00 $929.00 | 119 | |
La PMA est un activateur de la protéine kinase C (PKC). La PKC phosphoryle les résidus sérine et thréonine sur de nombreuses protéines cibles. Si « A030007L17Rik » fait partie d'une voie régulée par la PKC ou possède des sites de phosphorylation de sérine/thréonine, le PMA pourrait renforcer son activité fonctionnelle par ce mécanisme. | ||||||
Ionomycin | 56092-82-1 | sc-3592 sc-3592A | 1 mg 5 mg | $76.00 $265.00 | 80 | |
L'ionomycine est un ionophore calcique qui augmente les niveaux de calcium intracellulaire. Le calcium est un second messager dans de nombreuses voies de signalisation et peut activer des kinases dépendantes du calcium telles que la kinase dépendante de la calmoduline (CaMK). Si « A030007L17Rik » est activé par la CaMK ou fait partie des voies régulées par le calcium, l'ionomycine pourrait renforcer son activité. | ||||||
(−)-Epigallocatechin Gallate | 989-51-5 | sc-200802 sc-200802A sc-200802B sc-200802C sc-200802D sc-200802E | 10 mg 50 mg 100 mg 500 mg 1 g 10 g | $42.00 $72.00 $124.00 $238.00 $520.00 $1234.00 | 11 | |
L'EGCG est connu pour inhiber certains types de kinases. Si « A030007L17Rik » est régulé négativement par une kinase que l'EGCG inhibe, l'inhibition de cette kinase pourrait entraîner une augmentation indirecte de l'activité de « A030007L17Rik » en supprimant la phosphorylation inhibitrice. | ||||||
Lithium | 7439-93-2 | sc-252954 | 50 g | $214.00 | ||
Le chlorure de lithium inhibe la glycogène synthase kinase-3 (GSK-3). L'inhibition de la GSK-3 pourrait conduire à l'activation de voies de signalisation qui impliquent notamment la bêta-caténine. Si « A030007L17Rik » fait partie de la voie Wnt/bêta-caténine, le lithium pourrait indirectement activer « A030007L17Rik » en inhibant GSK-3. | ||||||
Okadaic Acid | 78111-17-8 | sc-3513 sc-3513A sc-3513B | 25 µg 100 µg 1 mg | $285.00 $520.00 $1300.00 | 78 | |
L'acide okadaïque est un puissant inhibiteur des protéines phosphatases PP1 et PP2A. Étant donné que A030007L17Rik est un nom générique et qu'il n'existe pas d'informations directes sur des activateurs ou des voies spécifiques, ma réponse se poursuivra par une analyse logique basée sur des mécanismes cellulaires connus qui pourraient potentiellement interagir avec une protéine générique ou l'activer. |