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versicanCRISPR激活质粒(h) | sc-401173-ACT | 20 µg | $397.00 |
VCAN 编码 versican(聚集蛋白聚糖),这是一种大型细胞外基质硫酸软骨素蛋白聚糖,可通过与透明质酸、连接蛋白以及生长因子相互作用,调控组织结构、含水状态以及细胞周围的信号传递。Versican 通过塑造整合素介导的信号线索并影响细胞外基质重塑程序,从而调节细胞黏附、迁移与增殖;其对炎症信号以及基质细胞–上皮细胞串话的影响具有情境依赖性。VCAN 表达水平及其同工型比例的改变与纤维化、血管重塑以及肿瘤相关基质有关,在这些情境中,细胞外基质的组成可调控侵袭能力与免疫细胞迁移。上述特征使 VCAN 成为研究发育、创伤修复以及与疾病相关的微环境中,由基质驱动的细胞行为调控的有用靶点。
versican CRISPR激活质粒(h)提供了一种靶向、非破坏性的方法,可在不改变底层DNA序列的情况下上调内源性VCAN的表达。
versican CRISPR激活质粒(h)是一个由三条质粒组成的协同激活介导(SAM)系统,旨在对人类细胞系中的VCAN基因座进行高效、位点特异性的转录上调。该系统以一种携带两个失活突变(D10A 和 N863A)的无催化活性的 Cas9(dCas9)为核心,这些突变消除了核酸酶活性,同时保留了 DNA 结合能力。该 dCas9 与强效转录激活因子 VP64 融合,并与用于筛选的布拉西定抗性基因共同表达。第二个质粒编码MS2-p65-HSF1融合蛋白——这一二级激活复合物与dCas9-VP64协同作用,并携带潮霉素抗性基因。第三个质粒编码靶标特异性20 nt sgRNA,其与两个MS2 RNA适配体融合,这些适配体可将MS2-p65-HSF1复合物招募至激活位点,并携带嘌呤霉素抗性基因。这三个质粒按1:1:1的质量比递送,以确保系统所有组分的平衡表达。
在靶位点组装完成后,SAM复合物结合于VCAN转录起始位点上游约200 bp处,VP64、p65和HSF1在此协同作用,招募转录 machinery并驱动内源性versican表达上调。与具有核酸酶活性的Cas9不同, dCas9不会引入双链断裂或修改基因组序列,从而保留了原生的VCAN位点,并能够研究内源性位点上依赖于versican的转录反应,使其成为功能研究、靶基因鉴定以及在VCAN表达被沉默或降低的肿瘤细胞中模拟versican通路恢复的宝贵工具。
仅供研究使用。不用于诊断或治疗。