Scratch1 Plásmido CRISPR/Cas9 KO (h): sc-410173

Descripción general

SCRT1 codifica Scratch1, un factor de transcripción con dedos de zinc que actúa predominantemente como represor transcripcional en linajes neuronales, ayudando a coordinar programas de diferenciación, migración y maduración neuronal. Scratch1 funciona dentro de redes reguladoras génicas que se intersectan con factores proneurales bHLH y con el control transcripcional relacionado con la EMT, moldeando transiciones de estado celular y la dinámica del citoesqueleto durante el desarrollo. Al modular la expresión génica específica de linaje y reprimir programas no neuronales, SCRT1 contribuye al mantenimiento de la identidad neuronal y al control dependiente del contexto de la proliferación. Los programas transcripcionales asociados a SCRT1 cuando están desregulados se han investigado en fenotipos del neurodesarrollo y en biología del cáncer, donde los reguladores del desarrollo se reutilizan con frecuencia para influir en el estado de diferenciación y la capacidad invasiva.

El plásmido CRISPR/Cas9 KO Scratch1 (h) es un conjunto de plásmidos diseñado para la interrupción dirigida del gen SCRT1 en líneas celulares human. Cada plásmido coexpresa un ARN guía único (sgRNA) dirigido a un sitio distinto dentro del SCRT1 junto con la nucleasa Cas9 de Streptococcus pyogenes. Los plásmidos también codifican GFP, lo que permite la identificación fluorescente y el enriquecimiento de las células transfectadas con éxito mediante microscopía de fluorescencia o citometría de flujo.

El diseño multiguía aumenta la probabilidad de generar inserciones o deleciones (indeles) que interrumpan el marco de lectura abierto de SCRT1 tras la formación de roturas de doble cadena mediadas por Cas9. Las roturas de ADN introducidas por el sistema CRISPR/Cas9 se reparan a través de vías endógenas de unión de extremos no homólogos (NHEJ), lo que con frecuencia da lugar a mutaciones de desplazamiento del marco de lectura que anulan la expresión de la proteína Scratch1.

Este sistema de knockout CRISPR permite la generación eficiente de modelos celulares deficientes en SCRT1 para la investigación de la señalización de Scratch1, estudios de genómica funcional, investigación en biología del cáncer y evaluación de respuestas terapéuticas en líneas celulares humanas.

Características principales

• sgRNA dirigidos a los exones de SCRT1 críticos para la función de Scratch1
  Coexpresión de SpCas9 y sgRNA a partir de un único plásmido para simplificar la administración
  Reportero GFP para la identificación de células transfectadas
  Conjunto de plásmidos dirigidos a múltiples sitios genómicos de SCRT1 para mejorar la eficiencia del knockout
  Compatible con la administración mediante transfección

Variantes de diseño

CRISPRs +/- HDRs

• Los gRNA codificados por el plásmido Scratch1 CRISPR/Cas9 KO (h) y el plásmido Scratch1 CRISPR/Cas9 KO (h2) se dirigen a sitios distintos dentro del locus SCRT1. Puede estar disponible uno o ambos diseños de orientación. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.
  Las construcciones donantes HDR codificadas por el plásmido HDR Scratch1 (h) y el plásmido HDR Scratch1 (h2) contienen un casete de resistencia a la puromicina y un reportero RFP flanqueado por brazos de homología SCRT1 para facilitar la reparación dirigida por homología en sitios diana SCRT1 definidos que se corresponden con los diseños de KO de CRISPR/Cas9. La disponibilidad de los donantes HDR puede variar. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.

Sólo para uso en investigación. No destinado a uso diagnóstico o terapéutico.