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RAP1 Plasmide di attivazione CRISPR (h) | sc-401709-ACT | 20 µg | $397.00 |
Il gene umano TERF2IP codifica RAP1, un fattore associato a shelterin che si lega a TRF2 per regolare la protezione dei telomeri, l’omeostasi della lunghezza telomerica e la soppressione di segnali aberranti di danno al DNA alle estremità dei cromosomi. Oltre ai telomeri, RAP1 influenza programmi trascrizionali e l’organizzazione della cromatina, ed è stato associato alla segnalazione infiammatoria mediata da NF-κB e a vie più ampie di stabilità del genoma. L’alterazione della funzione di RAP1 può modificare l’integrità dei telomeri, le risposte dei checkpoint e fenotipi simili alla senescenza cellulare, rendendo TERF2IP un bersaglio rilevante per studi sui meccanismi di mantenimento del genoma. La deregolazione della biologia dei telomeri e delle reti di segnalazione associate a RAP1 è spesso indagata nel contesto della trasformazione oncogena e della disfunzione cellulare legata all’età, senza implicare esiti clinici.
RAP1 Il plasmide di attivazione CRISPR (h) fornisce un approccio mirato e non distruttivo per sovraregolare l'espressione endogena di TERF2IP senza alterare la sequenza di DNA sottostante.
RAP1 Il plasmide di attivazione CRISPR (h) è un sistema SAM (mediatore di attivazione sinergico) a tre plasmidi progettato per la sovraregolazione trascrizionale altamente efficiente e sito-specifica del locus TERF2IP nelle linee cellulari umane. Il sistema è costruito attorno a una Cas9 cataliticamente inattiva (dCas9) che porta due mutazioni inattivanti (D10A e N863A) che eliminano l'attività nucleasica preservando al contempo il legame con il DNA. Questa dCas9 è fusa con VP64, un potente attivatore trascrizionale, ed è coespressa con un gene di resistenza alla blasticidina per la selezione. Il secondo plasmide codifica la proteina di fusione MS2-p65-HSF1, un complesso attivatore secondario che agisce in sinergia con dCas9-VP64, insieme a un gene di resistenza all'igromicina. Il terzo plasmide codifica un sgRNA specifico per il bersaglio di 20 nt fuso a due aptameri di RNA MS2 che reclutano il complesso MS2-p65-HSF1 nel sito di attivazione, accompagnato da un gene di resistenza alla puromicina. I tre plasmidi vengono somministrati in un rapporto di massa 1:1:1 per un'espressione bilanciata di tutti i componenti del sistema.
Una volta assemblato nel locus bersaglio, il complesso SAM si lega a circa 200 bp a monte del sito di inizio della trascrizione TERF2IP, dove VP64, p65 e HSF1 agiscono in modo concertato per reclutare il machinery trascrizionale e guidare la sovraregolazione dell'espressione endogena di RAP1. A differenza della Cas9 con attività nucleasica, dCas9 non introduce rotture a doppio filamento né modifica la sequenza genomica, preservando il locus TERF2IP nativo e consentendo lo studio delle risposte trascrizionali dipendenti da RAP1 nel locus endogeno, rendendolo uno strumento prezioso per studi funzionali, l'identificazione di geni bersaglio e la modellizzazione del ripristino della via RAP1 nelle cellule tumorali con espressione di TERF2IP silenziata o ridotta.
Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.