Los inhibidores químicos de ZNF555 utilizan diversos mecanismos para alterar su función. El disulfiram, el clioquinol, la 1,10-fenantrolina, el TPEN y el cloruro de cadmio actúan sobre los dominios de los dedos de zinc, que son cruciales para la capacidad de unión al ADN del ZNF555. El disulfiram y el clioquinol actúan como quelantes de metales, secuestrando iones de zinc y, por tanto, desestabilizando los motivos de los dedos de zinc. Esta pérdida de zinc altera la integridad estructural necesaria para que el ZNF555 se una eficazmente al ADN. La 1,10-fenantrolina amplía esta alteración al quelar los iones metálicos, lo que compromete la unión al ADN. Del mismo modo, el TPEN elimina los iones de zinc del ZNF555, provocando un cambio conformacional y una inhibición funcional. El cloruro de cadmio puede sustituir al zinc en los motivos de los dedos de zinc, lo que puede dar lugar a un ZNF555 mal plegado y funcionalmente inactivo.
Ebselen, Thiomersal y Withaferin A interfieren con la estructura de la proteína a través de sus interacciones con residuos de cisteína. La reactividad de Ebselen hacia los residuos de cisteína puede provocar un cambio conformacional que inhiba la actividad de ZNF555. El tiomersal se une a grupos sulfhidrilo dentro de dominios ricos en cisteína, alterando la estructura del ZNF555 e inhibiendo su función. La withaferina A también se une a los residuos de cisteína, y se supone que interfiere en la correcta formación de los dominios de dedos de zinc dentro del ZNF555. El piritionato de zinc altera la homeostasis del zinc, lo que puede dar lugar a una deficiencia de zinc para el ZNF555, inhibiendo aún más su función. El MG132 añade otra capa de inhibición al dirigirse a la vía ubiquitina-proteasoma, lo que conduce a la acumulación de proteínas ZNF555 mal plegadas, lo que reduce su población funcional. La triptolida inhibe factores de transcripción que son necesarios para las funciones reguladoras de ZNF555, lo que conduce a su inhibición. Por último, el PAC-1, al activar la caspasa-3, puede conducir a la degradación del ZNF555, inhibiendo eficazmente su presencia en la célula.
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