La activación molecular de la UPRT depende de una compleja red de vías de señalización, en la que varias moléculas pequeñas pueden desempeñar papeles fundamentales. Los compuestos que aumentan los niveles intracelulares de AMP cíclico (AMPc) son particularmente influyentes, ya que el AMPc actúa como un segundo mensajero que activa proteínas cinasas como la PKA. Cuando se activa, la PKA puede fosforilar varias proteínas, incluyendo potencialmente la UPRT, aumentando así su afinidad por los sustratos y potenciando su actividad enzimática. Del mismo modo, la inhibición de las fosfodiesterasas por determinadas moléculas puede impedir la descomposición del AMPc y el GMP cíclico, lo que conduce a su acumulación en el interior de las células y a la posterior activación de vías que regulan al alza la actividad de la UPRT. Los análogos del AMPc permeables a las células estimulan directamente estas vías, potenciando aún más la actividad de la PKA. Además, la inhibición de la proteína tirosina fosfatasas por ciertos compuestos de vanadio conduce a un aumento general de la fosforilación de proteínas, que también puede afectar el estado de fosforilación y la actividad de UPRT.
Otros activadores actúan modificando el entorno celular más amplio en el que opera la UPRT. La activación de la proteína cinasa activada por AMP (AMPK) mediante análogos de nucleótidos específicos afecta a varias vías metabólicas y podría aumentar la actividad de la UPRT mediante efectos alostéricos o fosforilación. La modulación de la actividad de GSK-3 o la alteración de los estados redox celulares mediante la suplementación de coenzimas esenciales son mecanismos adicionales por los que se puede influir indirectamente en la actividad de UPRT. Además, la activación de la proteína quinasa C (PKC) o la modulación de las cascadas de señalización MAPK pueden dar lugar a la fosforilación y activación de UPRT como parte de la respuesta celular a diferentes estímulos. Los inhibidores de la histona desacetilasa y ciertos compuestos naturales también pueden alterar los patrones de expresión génica, lo que podría conducir a un aumento de la actividad de la UPRT a través de modificaciones epigenéticas y los consiguientes cambios en la accesibilidad de la cromatina.
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