La actividad funcional de SPANX-N1 puede modularse a través de diversos mecanismos bioquímicos, cada uno de ellos asociado a distintas vías de señalización celular. Ciertas moléculas pequeñas pueden elevar segundos mensajeros intracelulares como el AMPc o el GMPc, que a su vez activan proteínas quinasas específicas. Estas quinasas, cuando se activan, son capaces de fosforilar proteínas entre las que se encuentra SPANX-N1, potenciando así su actividad. Por ejemplo, la activación de la adenilil ciclasa por determinados compuestos conduce a un aumento de los niveles de AMPc, que posteriormente activa la proteína cinasa A (PKA). La PKA puede entonces dirigirse a SPANX-N1 para su fosforilación, que es un mecanismo regulador común para la activación de proteínas. Además, los agonistas beta-adrenérgicos actúan por vías similares, provocando una elevación del AMPc y la subsiguiente activación de la PKA. Esta cascada de acontecimientos culmina en la fosforilación y activación funcional de SPANX-N1. Además, los compuestos que aumentan las concentraciones de calcio intracelular pueden activar las quinasas dependientes del calcio, que también pueden dirigirse a SPANX-N1, potenciando su actividad a través de la fosforilación.
Otras moléculas ejercen su influencia sobre la actividad de SPANX-N1 modulando el estado de fosforilación celular. Por ejemplo, la inhibición de las proteínas fosfatasas conduce a un aumento relativo de la fosforilación de las proteínas celulares. Si se inhiben estas fosfatasas, proteínas como SPANX-N1 pueden permanecer fosforiladas durante periodos prolongados, permaneciendo así en un estado activo. Los inhibidores de GSK-3, una quinasa implicada en múltiples vías celulares, también pueden contribuir indirectamente a la activación de las proteínas que se encuentran aguas abajo, incluyendo potencialmente a SPANX-N1. Además, ciertos factores de estrés ambiental pueden precipitar una respuesta celular que active las proteínas cinasas activadas por el estrés. Estas quinasas, a su vez, pueden fosforilar una plétora de proteínas dentro de la célula, una respuesta que podría abarcar la activación de SPANX-N1. Las moléculas que alteran la síntesis proteica normal también pueden invocar una respuesta al estrés, lo que conduce a la activación de las vías de respuesta al estrés que se dirigen a SPANX-N1 para su activación.
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