Los inhibidores de Rpp30 se diseñan principalmente en torno a la modulación de la síntesis, el procesamiento y la maduración del ARN. El Rpp30 desempeña un papel fundamental en la maduración del ARNt, y su función puede modularse influyendo en los procesos y vías más amplios del metabolismo del ARN. Sustancias químicas como la α-amanitina y la actinomicina D detienen la síntesis de ARN, lo que puede afectar a la abundancia y la dinámica de los sustratos de ARN sobre los que actúa la Rpp30.
Por otro lado, los análogos de nucleósidos como la Cordicepina y la Toyocamicina imitan a los nucleótidos nativos pero vienen con un golpe inhibidor. Su inclusión durante la síntesis de ARN puede alterar el metabolismo normal del ARN, modulando indirectamente los procesos en los que participa Rpp30. Del mismo modo, los compuestos que afectan al empalme, como la espliceostatina A y el pladienólido B, pueden configurar el paisaje del procesamiento del ARN e influir indirectamente en las operaciones en las que participa la Rpp30.
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