La inhibición directa de Rae-1ε mediante moléculas pequeñas sigue siendo un área inexplorada en la investigación científica, en gran parte debido al papel de la proteína en la señalización de las células inmunitarias y a la naturaleza de sus interacciones. Dirigirse a este tipo de proteínas suele requerir estrategias que van más allá de la tradicional unión molécula pequeña-proteína e implican la modulación de la expresión génica o la síntesis de proteínas. Las sustancias químicas como la hidroxiurea, la 5-azacitidina y el ácido valproico representan métodos indirectos para influir en la actividad de Rae-1ε. Estos compuestos actúan alterando procesos celulares como la replicación del ADN, la reparación y la regulación de la expresión génica. Por ejemplo, la hidroxiurea interfiere en la síntesis del ADN, lo que puede afectar a la expresión de proteínas implicadas en la regulación de las células inmunitarias. La 5-azacitidina modifica el paisaje epigenético, lo que puede conducir a una expresión alterada de los genes, incluidos los que codifican los ligandos NKG2D como Rae-1ε.
La inhibición por el ácido valproico de las histonas desacetilasas también puede provocar cambios en los patrones de expresión génica, afectando indirectamente a Rae-1ε. Este enfoque indirecto pone de relieve la comprensión y la estrategia actuales en la focalización de tales proteínas, centrándose en el contexto celular más amplio y en las redes reguladoras. Subraya la complejidad de modular la actividad de las proteínas en sistemas en los que se cuestiona la interacción directa con pequeñas moléculas. Los inhibidores de la histona desacetilasa, como la tricostatina A y el butirato sódico, modifican la estructura de la cromatina y, por consiguiente, la expresión génica, lo que puede influir en Rae-1ε. Los inhibidores del proteasoma, como Bortezomib y MG132, pueden inducir estrés del retículo endoplásmico (RE) y afectar a las vías de degradación de las proteínas implicadas en la regulación de Rae-1ε.
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