Los inhibidores químicos de la NUDT6 pueden ejercer sus efectos inhibidores funcionales a través de la interferencia con varias vías de señalización celular en las que participa la NUDT6. La suramina, un inhibidor de los receptores del factor de crecimiento, obstaculiza la función de los receptores del FGF, a los que se asocia la NUDT6 a través de su regulación del FGF-2 por ARN antisentido. Esta alteración puede conducir a una disminución de la señalización del FGF-2, inhibiendo así las funciones fisiológicas de NUDT6. Del mismo modo, el PD173074, un inhibidor selectivo del FGFR, se dirige directamente al FGFR, lo que conduce a una reducción de los procesos mediados por el FGF-2, que a su vez inhibe la actividad de la NUDT6. LY294002 y Wortmannin, ambos inhibidores de PI3K, pueden detener la vía PI3K/AKT, que se encuentra aguas abajo de la señalización de FGF-2. Dado que la NUDT6 está potencialmente implicada en esta vía, dicha inhibición puede suprimir su función. Además, U0126 y PD0325901, como inhibidores de MEK1/2, interrumpen la vía MAPK/ERK, lo que resulta en la inhibición de NUDT6 debido a su implicación putativa en esta vía. SP600125 y SB203580, que se dirigen a JNK y p38 MAPK respectivamente, también pueden inhibir la vía MAPK y, por tanto, la función de NUDT6.
Además, la Dorsomorfina, al inhibir la señalización BMP, puede indirectamente obstaculizar la actividad de la NUDT6, presumiendo que la NUDT6 actúa dentro de estas vías. La Rapamicina, un inhibidor de mTOR, puede suprimir el crecimiento celular y las señales de proliferación que están corriente abajo de FGF-2, que NUDT6 puede regular, llevando a su inhibición funcional. El inhibidor de ROCK Y-27632 puede alterar la organización del citoesqueleto de actina, un proceso en el que puede influir la señalización del FGF-2. Esta alteración puede restringir el crecimiento celular y la proliferación celular. Esta alteración puede restringir las funciones celulares en las que interviene NUDT6. ZM 447439, un inhibidor de la Aurora quinasa, afecta al ciclo celular y la mitosis, que son eventos celulares en los que NUDT6 podría desempeñar un papel a través de la vía de señalización del FGF-2, lo que conduce a la inhibición de NUDT6..
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