Los inhibidores químicos de la LYPD6 funcionan mediante diversos mecanismos para reducir la actividad de la proteína a través de la interferencia con los procesos de fosforilación. Bisindolilmaleimida I, Go 6983, Ro-31-8220, LY333531, Gö 6976, Queleritrina, Ruboxistaurina, Enzastaurina, Sotrastaurina, Hispidina, Balanol y Estaurosporina son todos ellos inhibidores dirigidos contra la proteína cinasa C (PKC), una cinasa que fosforila multitud de proteínas, entre las que se encuentra potencialmente la LYPD6. La bisindolilmaleimida I es un inhibidor selectivo de la PKC que impide la fosforilación de la LYPD6, lo que conduce a su inhibición funcional. De forma similar, Go 6983 suprime varias isoformas de PKC, que probablemente están implicadas en la fosforilación reguladora de LYPD6, inhibiendo así su actividad. Ro-31-8220, otro potente inhibidor de PKC, interrumpe la señalización de fosforilación necesaria para la función de LYPD6, inhibiendo así la proteína.
Siguiendo con el tema de la inhibición de la PKC, el LY333531 es un inhibidor selectivo de la PKCβ, una isoforma que puede regular la actividad de la LYPD6. Al dirigirse específicamente a la PKCβ, el LY333531 puede disminuir los eventos de señalización dependientes de la fosforilación que activan la LYPD6, lo que conduce a su inhibición. El Gö 6976, un inhibidor clásico de las isoenzimas PKC, y la Enzastaurina, un inhibidor más selectivo de la PKC, impiden ambos la fosforilación de la LYPD6, un paso necesario para su función. La enzastaurina es selectiva hacia la PKCβ y puede reducir la actividad de la LYPD6 inhibiendo la cinasa responsable de su activación. La sotrastaurina, aunque no es específica de la isoforma, inhibe la PKC y, por tanto, puede suprimir la fosforilación y posterior actividad de la LYPD6. La hispidina y el balanol, ambos potentes inhibidores de la PKC, disminuyen las vías de señalización de la fosforilación, lo que conduce a la inhibición de la LYPD6. Por último, la estaurosporina, conocida por su inhibición de quinasas de amplio espectro, impide la fosforilación de la LYPD6 mediada por la PKC, que es esencial para su actividad, lo que culmina en la inhibición funcional de la proteína. Cada una de estas sustancias químicas interrumpe la cascada de fosforilación necesaria para el correcto funcionamiento de la LYPD6 mediante la inhibición específica de la PKC, impidiendo así la fosforilación que normalmente potenciaría la actividad de la LYPD6.
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