La forskolina y el IBMX elevan los niveles de AMPc, un segundo mensajero con un amplio papel en la señalización celular, afectando así al estado funcional de las proteínas que responden al AMPc. La genisteína y el PD98059, al interferir con la señalización de la tirosina cinasa y la actividad de la MEK, respectivamente, tienen el potencial de alterar la actividad de las proteínas dentro de esas vías.
El LY294002 y la Wortmannina actúan como inhibidores de la PI3K, interrumpiendo una vía clave implicada en la regulación del crecimiento y la supervivencia celular, lo que puede tener amplias implicaciones para las proteínas que se encuentran aguas abajo de la señalización PI3K/Akt. El U0126 y el SB203580, al inhibir MEK y p38 MAPK respectivamente, pueden inducir cambios en proteínas reguladas por las vías MAPK/ERK y p38 MAPK, que son críticas para controlar la diferenciación celular, la proliferación y la respuesta al estrés. La inhibición de la señalización mTOR por la rapamicina puede afectar a la síntesis de proteínas y a la autofagia, modulando así las proteínas implicadas en el metabolismo y el crecimiento celulares. El KN-93, al dirigirse a la CaMKII, puede influir en las proteínas reguladas por procesos dependientes del calcio/calmodulina. La inhibición selectiva por el NF449 de la subunidad Gsα de las proteínas G puede influir en las proteínas reguladas por la señalización de los receptores acoplados a proteínas G.
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