La actividad funcional de GAGE12J puede potenciarse a través de diversos mecanismos bioquímicos, que implican principalmente la modulación de los sistemas de segundos mensajeros intracelulares. Uno de estos potentes mecanismos es la elevación del monofosfato de adenosina cíclico (AMPc) dentro de la célula. Este aumento de los niveles de AMPc se consigue mediante la estimulación directa de la adenilil ciclasa, que cataliza la conversión de ATP en AMPc. El aumento resultante de AMPc puede activar la proteína cinasa A (PKA), una molécula de señalización clave que puede fosforilar proteínas diana y modular diversas vías en las que está implicada la GAGE12J. Del mismo modo, el uso de análogos del AMPc sirve para eludir los receptores celulares y activar directamente la PKA, dando lugar a una cascada de acontecimientos de fosforilación que repercuten en el estado funcional de GAGE12J. Para amplificar aún más este efecto, los inhibidores de las fosfodiesterasas pueden impedir la descomposición del AMPc, manteniendo así niveles elevados de este segundo mensajero y potenciando la activación de GAGE12J.
Además del eje AMPc-PKA, la actividad de GAGE12J está influenciada por vías de señalización que implican iones de calcio. Compuestos específicos pueden aumentar las concentraciones de calcio intracelular, ya sea actuando como ionóforos que facilitan la entrada de calcio o activando receptores que desencadenan la liberación de calcio de las reservas intracelulares. Este aumento del calcio puede activar una serie de quinasas y fosfatasas dependientes del calcio, lo que conduce a la fosforilación o desfosforilación de proteínas dentro de las redes de señalización pertinentes para GAGE12J. Además, la modulación de la proteína quinasa C (PKC) mediante activadores que imitan el diacilglicerol (DAG) también contribuye a la regulación de las vías de señalización asociadas a GAGE12J.
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