Los inhibidores químicos de la Cyp3a25 incluyen una serie de compuestos que inhiben la función de la proteína a través de diversos mecanismos, todos los cuales implican una interacción directa con la propia enzima. El ketoconazol y el itraconazol inhiben la Cyp3a25 uniéndose al hierro hemo dentro del sitio activo de la enzima. Esta interacción impide que la enzima metabolice sus sustratos endógenos, reduciendo así su actividad. El ritonavir actúa de forma ligeramente diferente; es un inhibidor basado en un mecanismo que se une a la Cyp3a25 y provoca cambios estructurales en la proteína, lo que a su vez altera su función enzimática. El nelfinavir y el indinavir inhiben la Cyp3a25 ocupando directamente el sitio activo, lo que bloquea el acceso de los sustratos naturales que la enzima metabolizaría normalmente.
Además, el Saquinavir, la Claritromicina y la Eritromicina actúan como inhibidores competitivos de la Cyp3a25. Se unen preferentemente al sitio activo de la enzima, impidiendo la oxidación de los sustratos que la Cyp3a25 procesaría normalmente. El Diltiazem y el Verapamilo inhiben la enzima por modulación alostérica. El Diltiazem provoca un cambio conformacional en la Cyp3a25 que se traduce en una reducción de la actividad, mientras que el Verapamilo se une a sitios distintos del sitio activo, induciendo un efecto alostérico que disminuye la actividad de la enzima. La amiodarona interactúa directamente con Cyp3a25, lo que provoca una disminución del metabolismo de los sustratos de la enzima. Por último, la cimetidina actúa como inhibidor al unirse al sitio activo de la Cyp3a25, formando un bloqueo que impide la capacidad de la enzima para metabolizar los sustratos previstos. Cada una de estas sustancias químicas interactúa directamente con la Cyp3a25 de manera que inhibe su función normal, asegurando que la actividad de la enzima se reduzca sin afectar a los niveles de expresión o a la síntesis de la propia proteína.
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