Las sustancias químicas clasificadas como inhibidores de BEND3 son compuestos que pueden modular la función de BEND3 a través de mecanismos indirectos, principalmente afectando a la estructura y función de la cromatina. Se cree que BEND3 interviene en la organización de la cromatina y la regulación de la expresión génica. Por lo tanto, los compuestos químicos que alteran la estructura de la cromatina y las marcas epigenéticas pueden modular la función de BEND3 indirectamente alterando su sustrato: la propia cromatina o el paisaje epigenético.
Los inhibidores de la metiltransferasa del ADN como la 5-Aza-2'-desoxicitidina y el RG108 pueden interrumpir el reclutamiento de BEND3 a regiones metiladas del genoma cambiando el estado de metilación, afectando así a su papel en la expresión génica. Los inhibidores de la histona desacetilasa como la tricostatina A, el vorinostat, el butirato sódico y el ácido valproico pueden alterar los niveles de acetilación de las histonas, lo que puede influir en la estructura de la cromatina e interferir en la capacidad de BEND3 para mantener la organización de la cromatina. Compuestos como la Cloroquina y la Mitramicina A, al intercalarse o unirse al ADN, pueden impedir la correcta asociación de BEND3 con sus regiones diana de ADN, afectando a su función en la organización de la cromatina y la regulación transcripcional. El etopósido, al dirigirse a la topoisomerasa II del ADN, puede alterar la dinámica de la cromatina y, por tanto, afectar indirectamente a funciones de BEND3 relacionadas con la estructura de la cromatina de orden superior. Otros compuestos, como la genisteína y la curcumina, pueden modular diversas vías de señalización e influir en los factores de transcripción o en los complejos de remodelación de la cromatina, lo que a su vez puede afectar a la función de BEND3. El disulfiram, a través de su impacto sobre la actividad del proteasoma y la homeostasis de los iones metálicos, puede dar lugar a un entorno celular que afecte indirectamente a la participación de BEND3 en las funciones de remodelación de la cromatina.
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