Los inhibidores de AGAP1 están asociados a la intrincada red de procesos celulares relacionados con el tráfico vesicular, la dinámica del citoesqueleto y las vías relacionadas con Arf en las que opera AGAP1. La brefeldina A, por ejemplo, es conocida por alterar el aparato de Golgi mediante la inhibición de Arf1, lo que influye indirectamente en el papel de AGAP1 en el tráfico vesicular. Del mismo modo, SecinH3 es un inhibidor específico de la citohesina ArfGEFs, afectando así a la activación de Arf y potencialmente a las acciones de AGAP1 dentro de la célula.
En el frente endocítico, sustancias químicas como Exo2 y Dynasore actúan como disruptores. Mientras que Exo2 perturba la endocitosis general y las vías de tráfico de vesículas, Dynasore se dirige específicamente a la dinamina, una GTPasa implicada en la escisión de vesículas durante la endocitosis. Esta clase de inhibidores proporciona un conjunto de herramientas cruciales para comprender el panorama más amplio de los procesos celulares en los que opera AGAP1, incluso indirectamente. Además, la acción de sustancias químicas como CK666 y SMIFH2, que inhiben respectivamente el complejo Arp2/3 y las forminas, subraya la importancia de la dinámica de la actina para comprender el papel celular de AGAP1.
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