Los inhibidores dirigidos a la subunidad grande del factor de ensamblaje de la cromatina dependiente de ATP (ACF) son cruciales para modular su papel en el ensamblaje de los nucleosomas y la remodelación de la cromatina. Los compuestos que alteran la modificación postraduccional de las histonas, como los inhibidores de la histona desacetilasa, aumentan la acetilación de las histonas, lo que da lugar a un estado más relajado de la cromatina que reduce la capacidad de ACF para interactuar con la cromatina y ensamblar nucleosomas de forma eficaz. Del mismo modo, los inhibidores que afectan a los patrones de metilación del ADN y a las propiedades de unión al ADN, como los inhibidores de la metiltransferasa del ADN y de la unión a secuencias ricas en G-C, pueden impedir el reclutamiento y la posterior actividad de ACF en loci genómicos específicos. Esta alteración del paisaje cromatínico puede dar lugar a una menor demanda de los servicios de ensamblaje de cromatina de ACF.
Además, la regulación de la función de ACF se extiende a la influencia de procesos celulares y a la disponibilidad de factores modificadores de la cromatina relacionados. Los inhibidores del proteasoma, los agentes que alteran los microtúbulos y los inhibidores de las cinasas que modulan la actividad de los factores de transcripción y la progresión del ciclo celular pueden afectar indirectamente a la función de ensamblaje de la cromatina del ACF. Estos inhibidores pueden provocar una acumulación de proteínas poliubiquitinadas y cambios en la dinámica celular, lo que a su vez puede reducir la necesidad de remodelación de la cromatina por parte de ACF. Los inhibidores de la ARN polimerasa II, las proteínas bromodominio y las histonas acetiltransferasas también contribuyen a reducir la actividad funcional de la ACF al disminuir la demanda de ensamblaje de nucleosomas en respuesta a los cambios transcripcionales y al alterar las marcas epigenéticas que guían el proceso de remodelación de la cromatina.
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