PTPMT1 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h): sc-403905

Übersicht

PTPMT1 kodiert eine in den Mitochondrien lokalisierte Protein-Tyrosin-Phosphatase, die Phosphatidylglycerophosphat dephosphoryliert und damit die Cardiolipin-Biosynthese sowie die Integrität der inneren Mitochondrienmembran unterstützt. Durch die Regulierung der cardiolipinabhängigen Organisation von Superkomplexen der Atmungskette beeinflusst PTPMT1 die oxidative Phosphorylierung, die mitochondriale Dynamik und die zelluläre Energiehomöostase. Seine Aktivität greift in Lipid-Remodelling- und mitochondriale Stressantwort-Signalwege ein, die Proliferation und Überleben in metabolisch stark beanspruchten Zellen mitbestimmen. Eine Fehlregulation des PTPMT1-assoziierten mitochondrialen Lipidstoffwechsels wurde mit veränderter Bioenergetik und Redox-Balance in Verbindung gebracht und ist damit relevant für Studien zur metabolischen Anpassung und mitochondrialen Dysfunktion.

Das PTPMT1 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des PTPMT1-Gens in human-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des PTPMT1-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.

Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von PTPMT1 nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die PTPMT1-Proteinexpression aufheben.

Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von PTPMT1-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der PTPMT1-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.

Hauptmerkmale

• sgRNAs, die auf PTPMT1-Exone abzielen, die für die PTPMT1-Funktion entscheidend sind
  Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
  GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
  Pool von Plasmiden, die auf mehrere PTPMT1-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
  Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion

Designvarianten

CRISPRs +/- HDRs

• gRNAs, die vom PTPMT1 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) und vom PTPMT1 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des PTPMT1-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
  HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das PTPMT1 HDR-Plasmid (h) und PTPMT1 HDR-Plasmid (h2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von PTPMT1-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten PTPMT1-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.