IFN-ω Plasmide KO CRISPR/Cas9 (h): sc-409162

Panoramica

IFNW1 codifica l’interferone omega (IFN-ω), una citochina interferonica di tipo I che contribuisce alla difesa antivirale innata e alla regolazione immunitaria. In seguito all’interazione con il complesso recettoriale IFNAR, IFN-ω attiva una segnalazione dipendente da JAK1/TYK2 che induce la trascrizione, mediata da STAT1/STAT2/IRF9, dei geni stimolati dall’interferone (ISG), modulando la restrizione antivirale, la presentazione dell’antigene e il tono infiammatorio. Questa via si interseca con i programmi IRF e NF-κB per coordinare le risposte di rilevamento dei patogeni e il dialogo con l’immunità adattativa. Una segnalazione degli interferoni di tipo I deregolata è implicata nella suscettibilità alle infezioni virali, nell’infiammazione cronica e in fenotipi autoimmuni associati agli interferoni, rendendo IFNW1 un nodo utile per analizzare la biologia degli interferoni.

Il plasmide CRISPR/Cas9 KO IFN-omega (h) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene IFNW1 in linee cellulari human. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del IFNW1 insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.

Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto IFNW1 a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina IFN-omega.

Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di IFNW1 per lo studio della segnalazione di IFN-omega, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.

Caratteristiche principali

• sgRNA mirati agli esoni IFNW1 critici per la funzione di IFN-omega
  Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
  Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
  Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di IFNW1 per migliorare l'efficienza del knockout
  Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione

Varianti di progettazione

CRISPR +/- HDR

• Gli gRNA codificati dal IFN-omega CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h) e dal IFN-omega CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus IFNW1. Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
  I costrutti donatori HDR codificati dal IFN-omega Plasmide HDR (h) e il plasmide HDR IFN-omega (h2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia IFNW1 per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio IFNW1 definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.

Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.