DDX37 Plasmide KO CRISPR/Cas9 (h): sc-412866

Panoramica

DHX37 codifica per l’elicasi dell’RNA umana ATP-dipendente DDX37, una proteina della famiglia DEAD-box coinvolta nella biogenesi dei ribosomi e nel metabolismo dell’RNA. DDX37 partecipa a processi nucleolari, tra cui l’elaborazione del pre-rRNA e la maturazione della subunità ribosomiale piccola, sostenendo una traduzione efficiente e la progressione del ciclo cellulare. Grazie al suo ruolo nel rimodellamento, guidato da elicasi dell’RNA, dei complessi ribonucleoproteici, DDX37 si colloca in vie che coordinano l’elaborazione dell’RNA con i programmi proliferativi. L’alterazione genetica o la disregolazione di DHX37 è stata associata a fenotipi dello sviluppo e riproduttivi, rendendolo rilevante per lo studio della regolazione genica tessuto-specifica e dei meccanismi di malattia legati a un’elaborazione dell’RNA compromessa.

Il plasmide CRISPR/Cas9 KO DDX37 (h) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene DHX37 in linee cellulari human. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del DHX37 insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.

Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto DHX37 a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina DDX37.

Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di DHX37 per lo studio della segnalazione di DDX37, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.

Caratteristiche principali

• sgRNA mirati agli esoni DHX37 critici per la funzione di DDX37
  Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
  Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
  Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di DHX37 per migliorare l'efficienza del knockout
  Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione

Varianti di progettazione

CRISPR +/- HDR

• Gli gRNA codificati dal DDX37 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h) e dal DDX37 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus DHX37. Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
  I costrutti donatori HDR codificati dal DDX37 Plasmide HDR (h) e il plasmide HDR DDX37 (h2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia DHX37 per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio DHX37 definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.

Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.