CAB39L CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h): sc-416543

Übersicht

CAB39L kodiert das calciumbindende Protein 39-like, einen konservierten Adapter, der mit der Serin/Threonin-Kinase STK11/LKB1 interagiert und die Bildung sowie Funktion des Scaffold-Komplexes LKB1–STRAD–CAB39 fördert. Über diesen Komplex unterstützt CAB39L die Aktivierung von Kinasen der AMPK-Familie und verknüpft damit den zellulären Energiestatus mit metabolischer Kontrolle, Stressantworten und Polarisationsprogrammen. CAB39L-abhängige Signalwege beeinflussen über AMPK-verwandte Pfade Prozesse wie mitochondriale Homöostase, die Regulation der Autophagie und die epitheliale Organisation. Eine Fehlregulation von Komponenten der LKB1-AMPK-Achse ist mit der Krebsbiologie und Mechanismen metabolischer Erkrankungen verknüpft, was CAB39L zu einem nützlichen Knotenpunkt macht, um die Verschaltung des Signalwegs und kontextspezifische Verwundbarkeiten zu untersuchen.

Das CAB39L CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des CAB39L-Gens in human-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des CAB39L-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.

Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von CAB39L nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die CAB39L-Proteinexpression aufheben.

Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von CAB39L-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der CAB39L-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.

Hauptmerkmale

• sgRNAs, die auf CAB39L-Exone abzielen, die für die CAB39L-Funktion entscheidend sind
  Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
  GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
  Pool von Plasmiden, die auf mehrere CAB39L-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
  Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion

Designvarianten

CRISPRs +/- HDRs

• gRNAs, die vom CAB39L CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) und vom CAB39L CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des CAB39L-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
  HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das CAB39L HDR-Plasmid (h) und CAB39L HDR-Plasmid (h2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von CAB39L-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten CAB39L-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.