BDP1 Plásmido CRISPR/Cas9 KO (m): sc-422508

Descripción general

Ptpn18 codifica una fosfatasa de tirosina implicada en la regulación de la señalización de receptores tirosina quinasas (RTK) y de vías posteriores dependientes de la fosforilación que determinan el crecimiento celular, la adhesión y la motilidad. En células de ratón, PTPN18 se ha relacionado con la modulación de la señalización de EGFR/de la familia ErbB y con procesos de tráfico de proteínas que influyen en la duración de la señal y su organización espacial. Mediante la desfosforilación de sustratos específicos, PTPN18 puede afectar salidas asociadas a MAPK y PI3K, integrando señales que inciden en la dinámica del citoesqueleto y en las respuestas celulares al estrés. La actividad fosfatasa desregulada y la señalización RTK alterada se asocian ampliamente con programas de señalización oncogénica y fenotipos inflamatorios, lo que convierte a Ptpn18 en una diana útil para estudios mecanísticos en modelos relevantes de enfermedad.

El plásmido CRISPR/Cas9 KO BDP1 (m) es un conjunto de plásmidos diseñado para la interrupción dirigida del gen Ptpn18 en líneas celulares mouse. Cada plásmido coexpresa un ARN guía único (sgRNA) dirigido a un sitio distinto dentro del Ptpn18 junto con la nucleasa Cas9 de Streptococcus pyogenes. Los plásmidos también codifican GFP, lo que permite la identificación fluorescente y el enriquecimiento de las células transfectadas con éxito mediante microscopía de fluorescencia o citometría de flujo.

El diseño multiguía aumenta la probabilidad de generar inserciones o deleciones (indeles) que interrumpan el marco de lectura abierto de Ptpn18 tras la formación de roturas de doble cadena mediadas por Cas9. Las roturas de ADN introducidas por el sistema CRISPR/Cas9 se reparan a través de vías endógenas de unión de extremos no homólogos (NHEJ), lo que con frecuencia da lugar a mutaciones de desplazamiento del marco de lectura que anulan la expresión de la proteína BDP1.

Este sistema de knockout CRISPR permite la generación eficiente de modelos celulares deficientes en Ptpn18 para la investigación de la señalización de BDP1, estudios de genómica funcional, investigación en biología del cáncer y evaluación de respuestas terapéuticas en líneas celulares humanas.

Características principales

• sgRNA dirigidos a los exones de Ptpn18 críticos para la función de BDP1
  Coexpresión de SpCas9 y sgRNA a partir de un único plásmido para simplificar la administración
  Reportero GFP para la identificación de células transfectadas
  Conjunto de plásmidos dirigidos a múltiples sitios genómicos de Ptpn18 para mejorar la eficiencia del knockout
  Compatible con la administración mediante transfección

Variantes de diseño

CRISPRs +/- HDRs

• Los gRNA codificados por el plásmido BDP1 CRISPR/Cas9 KO (m) y el plásmido BDP1 CRISPR/Cas9 KO (m2) se dirigen a sitios distintos dentro del locus Ptpn18. Puede estar disponible uno o ambos diseños de orientación. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.
  Las construcciones donantes HDR codificadas por el plásmido HDR BDP1 (m) y el plásmido HDR BDP1 (m2) contienen un casete de resistencia a la puromicina y un reportero RFP flanqueado por brazos de homología Ptpn18 para facilitar la reparación dirigida por homología en sitios diana Ptpn18 definidos que se corresponden con los diseños de KO de CRISPR/Cas9. La disponibilidad de los donantes HDR puede variar. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.

Sólo para uso en investigación. No destinado a uso diagnóstico o terapéutico.