Chemische Inhibitoren von FBXO16 können dessen Funktion im Ubiquitin-Proteasom-System (UPS) beeinträchtigen, einem zellulären Weg, der für den Abbau fehlgefalteter, geschädigter oder regulatorischer Proteine verantwortlich ist. Proteasominhibitoren wie MG132, Bortezomib, Epoxomicin, Lactacystin, MLN2238 (Ixazomib), Carfilzomib, Delanzomib, Marizomib, Oprozomib, Withaferin A und Celastrol stören diese Proteinabbaumaschinerie. FBXO16 ist Teil eines E3-Ubiquitin-Ligase-Komplexes, der Proteine mit Ubiquitin-Molekülen markiert und ihnen damit signalisiert, dass sie durch das Proteasom abgebaut werden sollen. Durch die Hemmung des Proteasoms können diese Chemikalien eine Anhäufung von Proteinen verursachen, die FBXO16 normalerweise für den Abbau markieren würde. Diese Anhäufung kann das UPS sättigen und den Umsatz von Proteinen beeinträchtigen, was zu einer funktionellen Hemmung von FBXO16 führt. Die Anhäufung ubiquitinierter Proteine aufgrund der Proteasomhemmung kann auch die Aktivität von FBXO16 hemmen, indem sie seinen Zugang zu Substraten behindert oder seinen Regulationszustand verändert.
Darüber hinaus kann PR-619, ein Deubiquitinase-Inhibitor mit breitem Wirkungsspektrum, die Aktivität von FBXO16 ebenfalls modulieren. Deubiquitinasen sind Enzyme, die Ubiquitinmoleküle von Proteinen entfernen und sie so oft vor dem Abbau bewahren. Durch die Hemmung von Deubiquitinasen kann PR-619 zu einer anormalen Anhäufung von ubiquitinierten Proteinen führen. Diese abnorme Ubiquitinierung kann wiederum die normale Funktion von FBXO16 behindern, indem sie entweder seine Substrate direkt verändert oder das fein abgestimmte Gleichgewicht von Ubiquitinierung und Deubiquitinierung stört, auf das FBXO16 angewiesen ist, um seine Rolle beim Proteinumsatz zu erfüllen. Folglich kann die Hemmung von Deubiquitinasen indirekt die Funktion von FBXO16 hemmen, indem sie es daran hindert, Proteine effektiv für den Abbau zu markieren, wodurch die Rolle des Proteins im UPS funktionell gehemmt wird.
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