CCDC97-Inhibitoren umfassen eine Gruppe von Verbindungen, die auf verschiedene Signalwege abzielen, die an der Regulierung der CCDC97-Aktivität beteiligt sind. Rapamycin und Torin 1 unterdrücken als mTOR-Inhibitoren direkt die mTORC1- bzw. mTORC2-Komplexe. Da die mTOR-Signalübertragung für eine Reihe von zellulären Prozessen, zu denen auch die Stabilität und Funktion von CCDC97 gehören könnte, von entscheidender Bedeutung ist, würde die Hemmung von mTOR durch diese Verbindungen zu einem weniger günstigen Umfeld für die Aktivität von CCDC97 führen. Es wird davon ausgegangen, dass CCDC97 für seine Funktion die mTOR-vermittelte Phosphorylierung benötigt; daher würde die Hemmung von mTOR zu einer direkten Verringerung der CCDC97-Aktivität führen.
Darüber hinaus zielen Verbindungen wie Wortmannin und LY294002, die PI3K-Inhibitoren sind, und PD98059 und U0126, die MEK-Inhibitoren sind, auf vorgelagerte Kinasen innerhalb des PI3K/AKT- bzw. MAPK/ERK-Wegs ab. Die Hemmung dieser Kinasen würde zu einer verringerten Aktivierung nachgeschalteter Ziele führen, zu denen auch CCDC97 gehören könnte. Wenn die Aktivität von CCDC97 von der Signalübertragung über diese Wege abhängt, z. B. durch AKT-vermittelte oder ERK-vermittelte Phosphorylierung, dann würden diese Inhibitoren zu einer Abnahme der CCDC97-Funktion führen.
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