透明帯結合タンパク質1(ZPBP1)の化学的阻害剤は、様々な生化学的経路を通じて、その機能を効果的に阻害することができる。グルコーストランスポーターを阻害する能力で知られる化合物であるフロレチンは、ZPBP1が適切に機能するために不可欠なグリコシル化プロセスを阻害することができる。フロレチンの作用によってグリコシル化基質が不足すると、ZPBP1の機能障害につながる。同様に、ゲニステインはZPBP1を含む多くのタンパク質のリン酸化を担う酵素であるチロシンキナーゼを標的とする。これらのキナーゼを阻害することにより、ゲニステインはZPBP1の活性に重要なリン酸化を減少させ、その阻害につながる。もう一つのキナーゼ阻害剤PD 98059は、細胞内のリン酸化過程に極めて重要なMEK活性を阻害する。この阻害は、ZPBP1の必須のリン酸化を妨げ、それによってその機能的活性を阻害する。
さらに、PI3Kの阻害剤であるLY294002とWortmanninは、ZPBP1の細胞内での役割に不可欠なシグナル伝達経路を阻害することができる。これらの化学物質によるPI3Kの阻害は、ZPBP1の重要なシグナル伝達カスケードへの関与を妨げる下流への影響をもたらす可能性がある。SB203580とSP600125は、それぞれp38 MAPKとJNKの阻害剤として、ZPBP1が役割を果たす可能性のある細胞ストレス応答経路を破壊し、間接的にその機能を阻害する可能性がある。PKC阻害剤であるGö 6983とBisindolylmaleimide Iは、ZPBP1のリン酸化を阻害し、細胞シグナル伝達と制御に関連するZPBP1の活性を阻害する。ROCK阻害剤であるY-27632は、アクチン細胞骨格の動態を乱し、細胞構造の維持に関与しているZPBP1の間接的な機能阻害につながる可能性がある。最後に、BAPTA-AMは、細胞内カルシウムをキレートすることにより、ZPBP1に関連するカルシウム依存性プロセスを破壊し、細胞内でのZPBP1の機能阻害にさらに寄与する可能性がある。
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