Gli inibitori chimici di ZNF708 comprendono una serie di composti che esercitano i loro effetti inibitori interagendo con i domini zinc finger della proteina, fondamentali per la sua capacità di legare il DNA e le sue funzioni regolatorie. Il disulfiram, il clotrimazolo, l'ebselen, lo zinco piritione, la 1,10-fenantrolina, il clioquinolo, il PDTC e il tiludronato funzionano tutti chelando gli ioni di zinco o legandosi direttamente ai motivi zinc finger di ZNF708. Questo legame o chelazione porta a un'alterazione conformazionale della struttura del dito di zinco, impedendo direttamente la capacità di ZNF708 di interagire con il DNA. Tale alterazione determina l'inibizione dell'attività di regolazione trascrizionale di ZNF708. Ad esempio, il disulfiram e il clotrimazolo possono legarsi ai motivi delle dita di zinco, impedendo a ZNF708 di agganciarsi ai suoi bersagli del DNA. In modo simile, ebselen modifica i residui di cisteina, il che probabilmente altera la conformazione di ZNF708 e ostacola la sua funzionalità di legame al DNA.
Inoltre, anche l'inibizione di specifiche vie cellulari svolge un ruolo nella soppressione dell'attività di ZNF708. Sostanze chimiche come TPCA-1 e triptolide inibiscono la via NF-κB, che è parte integrante del ruolo di ZNF708 nella regolazione dell'espressione genica. Sopprimendo l'attivazione di NF-κB, questi composti ostacolano direttamente la capacità di ZNF708 di modulare l'espressione genica. Inoltre, NSC 95397 inibisce la fosfatasi Cdc25, portando a cambiamenti nello stato di fosforilazione che ZNF708 richiede per la sua attività. Questa alterazione della fosforilazione può portare all'inibizione funzionale di ZNF708. Infine, MG-132 ha come bersaglio l'attività del proteasoma, con conseguente accumulo di proteine all'interno della cellula che possono interrompere le vie di segnalazione in cui opera ZNF708.
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