Os inibidores químicos do ZNF565 podem interagir com várias vias de sinalização e enzimas para modular a sua atividade. O PD168393, um inibidor irreversível da tirosina quinase do EGFR, liga-se ao local de ligação do ATP da enzima, resultando na interrupção das vias de sinalização a jusante que são cruciais para a regulação funcional do ZNF565. Do mesmo modo, o gefitinib inibe seletivamente a tirosina quinase EGFR, afectando as vias de sinalização celular que interagem com o ZNF565. O SU5402, um inibidor seletivo da tirosina quinase do FGFR, bloqueia a via de sinalização do FGFR que pode modular proteínas que, direta ou indiretamente, regulam a atividade do ZNF565. Além disso, a inibição específica da PI3K por LY294002 e Wortmannin impede a fosforilação de alvos a jusante, que podem incluir vias de sinalização que regulam o ZNF565, levando a uma diminuição da sua atividade funcional.
Além disso, o SB203580 tem como alvo a p38 MAP quinase, que está envolvida nas respostas celulares a vários estímulos e, ao inibir esta quinase, pode perturbar a sinalização necessária para a atividade óptima do ZNF565. A inibição da mTOR pela rapamicina também afecta o ZNF565, alterando o ambiente celular e as vias de sinalização de que pode depender. O U0126, como inibidor da MEK1/2, leva à diminuição da ativação da ERK, outra quinase que pode ser essencial para a regulação da função do ZNF565. O PP2, que inibe as tirosina-cinases da família Src, e o Dasatinib, um inibidor de tirosina-cinase de largo espetro, reduzem a fosforilação de substratos nas vias de sinalização que regulam a atividade do ZNF565. A inibição da proteína quinase associada a Rho (ROCK) pelo Y-27632 poderia alterar o citoesqueleto de actina e a motilidade celular, o que pode ser necessário para a função do ZNF565. Por último, o SP600125, um inibidor da c-Jun N-terminal kinase (JNK), influencia as vias de resposta ao stress que estão implicadas na regulação do ZNF565, contribuindo assim para a inibição da sua atividade.
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