Gli inibitori chimici di ZFP62 possono interferire con la sua funzione impedendo la sua fosforilazione, una modifica spesso necessaria per la sua attivazione. La forskolina, un attivatore diretto dell'adenilato ciclasi, innalza i livelli intracellulari di cAMP, il che porta tipicamente all'attivazione della PKA. Tuttavia, nel contesto dell'inibizione, l'assenza di forskolina significherebbe che questa via non è impegnata, impedendo così la fosforilazione e la successiva attivazione di ZFP62 da parte della PKA. Analogamente, anche l'8-Br-cAMP, un analogo del cAMP, e il Dibutirril-cAMP attivano la PKA, che a sua volta può fosforilare ZFP62. Senza queste molecole, la via di attivazione della PKA e la fosforilazione di ZFP62 non sono facilitate. L'IBMX, inibendo le fosfodiesterasi, aumenta i livelli di cAMP e cGMP, che normalmente porterebbero all'attivazione della PKA o della PKG e quindi alla fosforilazione di ZFP62. Senza IBMX, la degradazione di cAMP e cGMP da parte delle fosfodiesterasi non sarebbe ostacolata, con conseguente minore attivazione di PKA o PKG e minore fosforilazione di ZFP62.
Altri inibitori come il PMA, che attiva la PKC, potrebbero influenzare ZFP62 fosforilandolo. Senza PMA, la PKC è meno attiva e quindi la fosforilazione di ZFP62 è ridotta. La calicolina A e l'acido okadaico, entrambi inibitori delle fosfatasi proteiche, in loro assenza, permetterebbero la de-fosforilazione di ZFP62, mantenendolo in uno stato meno attivo. L'anisomicina, che attiva le protein chinasi attivate dallo stress, non sarebbe in grado di promuovere la fosforilazione di ZFP62 di fronte allo stress ambientale senza la sua presenza. Zaprinast, un inibitore della PDE5, porta a un aumento dei livelli di cGMP e alla successiva attivazione della PKG, che fosforila ZFP62. Senza Zaprinast, i livelli di cGMP non sarebbero elevati, con conseguente minore attivazione della PKG e quindi minore fosforilazione di ZFP62. Infine, l'iperforina attiva i canali TRPC6 causando un afflusso di ioni Ca2+ e l'attivazione di chinasi calcio-dipendenti, che potrebbero fosforilare ZFP62; senza iperforina, questo afflusso e la successiva attivazione non si verificherebbero, con conseguente riduzione della fosforilazione e dell'attivazione di ZFP62.
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