ZCCHC17の化学的阻害剤には、細胞成分、特にDNAと相互作用する能力を阻害する様々な化合物が含まれる。ナトリウムチャネルを阻害することで知られるフェニトインは、ZCCHC17の機能に不可欠なタンパク質のDNA結合能を制限することで、その阻害作用をZCCHC17にまで拡大する。同様に、クロルプロマジンは主に神経伝達物質受容体に作用するが、細胞内シグナル伝達と神経伝達物質放出を変化させることにより、間接的にZCCHC17に影響を与え、DNA結合タンパク質の機能を変化させる。幅広い受容体拮抗作用を有する本薬は、細胞内環境を変化させ、神経伝達物質レベルに影響を与え、間接的にZCCHC17の機能を阻害する可能性がある。ヒストン脱アセチル化酵素阻害剤であるバルプロ酸は、クロマチン構造とアクセシビリティを変化させ、ZCCHC17とDNAとの相互作用を低下させる。ミトラマイシンAは、ZCCHC17と直接競合してDNAに結合し、マイナーグルーブ内のGCリッチ配列に引っ掛かり、タンパク質の遺伝子制御の役割を妨害する。ピリチオン亜鉛は亜鉛のホメオスタシスを破壊し、構造的・機能的に亜鉛に依存しているZCCHC17を阻害する可能性がある。5-アザシチジンやRG108のようなDNAメチル化酵素阻害剤は、DNAのメチル化を低下させることでZCCHC17を阻害し、ZCCHC17の効力を低下させる遺伝子発現パターンの変化を引き起こす。
ジスルフィラムは、ZCCHC17のジンクフィンガードメインの維持に不可欠な金属イオンのバランスを崩すことにより、ZCCHC17を阻害する可能性がある。トリプトライドは、ZCCHC17の制御機能に必要な遺伝子プロモーターへのリクルートメントを阻害することにより、ZCCHC17を阻害することができる。フェネチルイソチオシアネート(PEITC)は、タンパク質のDNA結合活性に重要なアミノ酸と反応することでZCCHC17を阻害することができる。最後に、C646はヒストンのアセチル化レベルに影響を与えることによってZCCHC17を阻害することができ、これによってタンパク質のクロマチンへのアクセスが制限され、その結果遺伝子発現を制御する能力が制限される可能性がある。それぞれの化学物質は、ZCCHC17の機能的発現に重要な特定の経路や細胞プロセスを標的とし、その阻害につながる。
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