ZBTB44 nutzen verschiedene Mechanismen, um den Phosphorylierungszustand und die Aktivität dieses Proteins zu modulieren. Durch die Aktivierung der Adenylylcyclase erhöht Forskolin die intrazelluläre Konzentration von zyklischem AMP, das wiederum die Proteinkinase A (PKA) aktiviert. PKA, eine wichtige Kinase bei zahlreichen zellulären Prozessen, kann ZBTB44 phosphorylieren und damit seine Funktion verändern. In ähnlicher Weise aktiviert Dibutyryl-cAMP, ein membrandurchlässiges Analogon von cAMP, PKA und kann ebenfalls zur Phosphorylierung von ZBTB44 führen. In einem verwandten Weg aktiviert PMA die Proteinkinase C (PKC), eine weitere Kinase mit weitreichenden zellulären Funktionen, die dann ZBTB44 zur Phosphorylierung anvisieren kann. Thapsigargin und Ionomycin erhöhen beide den intrazellulären Kalziumspiegel, jedoch über unterschiedliche Mechanismen. Thapsigargin hemmt die SERCA-Pumpe, was zu einem Anstieg des zytosolischen Kalziumspiegels führt, während Ionomycin als Kalzium-Ionophor wirkt und das intrazelluläre Kalzium direkt erhöht, was eine Reihe von kalziumabhängigen Proteinkinasen aktivieren kann, die ZBTB44 phosphorylieren können.
Weitere Chemikalien wirken durch die Hemmung von Phosphatasen, was wiederum zu einer erhöhten Phosphorylierung von Zellproteinen einschließlich ZBTB44 führt. Calyculin A und Okadainsäure sind starke Inhibitoren der Serin/Threonin-Phosphatasen PP1 und PP2A, was dazu führt, dass der Phosphorylierungszustand ihrer Substratproteine erhalten bleibt. Cantharidin hemmt diese Phosphatasen ebenfalls, was zu einem ähnlichen Ergebnis führt. Eine weitere Ebene der Regulierung bietet Anisomycin, das stressaktivierte Proteinkinasen induziert, und obwohl es in erster Linie als Proteinsynthesehemmer bekannt ist, kann es indirekt zur Phosphorylierung von ZBTB44 führen. Piceatannol und Staurosporin sind zwar typische Kinaseinhibitoren, können aber zu kompensatorischen zellulären Reaktionen führen, die alternative Wege aktivieren, die zur Phosphorylierung von ZBTB44 führen. Staurosporin kann, insbesondere bei niedrigen Konzentrationen, nicht selektiv Kinasen aktivieren, die möglicherweise auf ZBTB44 abzielen. Schließlich moduliert FTY720, nachdem es in vivo phosphoryliert wurde, Sphingosin-1-Phosphat-Rezeptoren, was nachgeschaltete Effekte haben kann, zu denen auch die Aktivierung von ZBTB44 gehört.
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