タンパク質Tim22の化学的阻害剤は、タンパク質輸入における活性に不可欠なミトコンドリアのプロセスを阻害することによって機能する。例えばアンチマイシンAは、電子伝達鎖の複合体IIIを標的とし、Tim22がタンパク質の移入に依存しているミトコンドリアの呼吸とATP生成を阻害する。同様のメカニズムで、オリゴマイシンAとオリゴマイシンはATP合成酵素に結合し、ATPの産生を阻害するため、Tim22の活動に必要なエネルギーを奪う。ベンチュリシジンAもATP合成酵素を阻害するが、ATP合成に重要なF_o領域を介したプロトン移動を阻害することによって阻害する。この作用によりATPの供給が減少し、Tim22の機能が阻害される。
さらに、CCCPはプロトントフォアとして働き、Tim22がタンパク質輸入機構に利用する膜電位の維持に極めて重要なプロトン勾配を消失させる。オーロベルチンBは、F_1-ATPaseのβサブユニットに結合することにより、ATP形成を阻害し、Tim22のトランスロカーゼ活性に影響を与える。コンカナマイシンAは、V型ATPaseを阻害することによりプロトン勾配を破壊し、CCCPと同様の結果をもたらす。ロテノンとピエリシジンAはともに複合体Iを阻害し、ATP合成に必要なプロトン勾配を減少させ、その結果Tim22の活性に影響を与える。最後に、ボンクレキン酸とアトバコンは、それぞれアデニンヌクレオチドトランスロケーターと複合体IIIに作用し、ミトコンドリア内膜を横切るADP/ATP交換を阻害したり、シトクロムb成分を阻害したりして、Tim22の機能を破壊する。
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