TAF II p105阻害剤には、タンパク質やその関連経路と相互作用してその活性を調節する様々な化学物質が含まれる。これらの阻害剤は、タンパク質の正常な機能にとって重要な細胞プロセスやシグナル伝達経路を阻害することによって、間接的にTAF II p105に影響を与える。上に挙げた化学物質は、クルクミンやレスベラトロールのようなポリフェノールを含む多様な化学クラスを代表するもので、それぞれTAF II p105の他の転写因子との相互作用やストレス応答経路における役割を阻害する可能性がある。ゲニステインのようなイソフラボノイド、ケルセチンのようなフラボノイド、EGCGのようなカテキンは、TAF II p105のリン酸化状態を変化させるキナーゼ経路やその他のシグナル伝達カスケードに影響を与え、転写調節機能に影響を与えることができる構造を持っている。
TAF II p105を阻害する化学物質の多くは、NF-kB経路を阻害することが知られているジテルペン・トリエポキシド・トリプトリドや、様々なシグナル伝達経路に作用するフラボノリグナン・シリビニンなど、食品や植物に含まれる天然由来の化合物である。ベルベリンのようなアルカロイドは代謝シグナル伝達に影響を与え、スルフォラファンのような有機硫黄化合物は抗酸化反応経路を調節し、どちらもTAF II p105活性に影響を与える。もう一つのフラボンであるウォゴニンは、TAF II p105の転写活性に重要なシグナル伝達経路に影響を与える。最後に、PI3K/Akt経路の低分子阻害剤であるLY294002のような合成化合物は、TAF II p105の機能を間接的に調節しうる化学的相互作用の幅広さを示している。
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