シンテニン-2の化学的阻害剤は、シンテニン-2が相互作用する細胞骨格やシグナル伝達経路の様々な成分を標的とすることにより、その機能に影響を与えることができる。WortmanninとLY294002は、アクチン細胞骨格の制御に重要なホスホイノシチド3-キナーゼ(PI3K)を標的とする阻害剤であり、細胞骨格組織におけるシンテニン-2の役割に影響を与える。PI3Kを阻害することにより、これらの化学物質は、シンテニン-2が細胞接着と運動を維持するために依存していると思われる下流のシグナル伝達経路を混乱させる可能性がある。一方、サイトカラシンDとラトルンクリンAは、アクチン細胞骨格そのものに直接作用する。シトカラシンDはアクチンフィラメントの伸長端に結合し、その伸長を妨げて解重合を促進し、ラトルンクリンAはアクチンモノマーを隔離し、その重合を妨げる。これらの作用はアクチン細胞骨格の破壊につながり、その結果、シンテニン-2が細胞プロセスで果たす構造的役割を阻害する。
さらにアクチンの動態に影響を与えるCK-636とSMIFH2は、それぞれArp2/3複合体とホルミンを標的とすることによって、アクチンの核形成と伸長を阻害する。CK-636はアクチンフィラメントの形成と分岐を阻害することにより、アクチンネットワークの構造的完全性を破壊し、一方SMIFH2はアクチンフィラメントの伸長を阻害することができ、これらはどちらもシンテニン-2の機能に必須である。さらに、ブレビスタチンとML-7は、それぞれミオシンIIとミオシン軽鎖キナーゼ(MLCK)を標的とし、シンテニン-2とアクチン構造との会合に重要な細胞収縮力の低下と細胞骨格の張力の変化をもたらす。Gö 6983はプロテインキナーゼC(PKC)アイソフォームを阻害し、細胞骨格構成と細胞接着を調節するシグナル伝達経路に影響を与え、その結果、これらのプロセスにおけるシンテニン-2の役割に影響を与える可能性がある。最後に、Y-27632とNSC23766はRhoファミリーの低分子GTPaseシグナル伝達経路に影響を与える。Y-27632はRho関連タンパク質キナーゼ(ROCK)を阻害し、NSC23766はRac1の活性化を阻害するが、これらはいずれもアクチン細胞骨格の動態に必須であり、ひいては細胞の形態や運動性に関連するシンテニン-2の生物学的活性に必須である。
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