Los inhibidores de SOXN abarcan una gama diversa de compuestos que ejecutan su función inhibidora a través de varias vías bioquímicas. La regulación a la baja de la vía de señalización hedgehog por determinados inhibidores conduce a una disminución de la actividad transcripcional de SOXN, que es parte integrante de esta vía, atenuando así su papel funcional. Del mismo modo, el bloqueo de la vía PI3K/Akt mediante inhibidores específicos puede reducir los efectos descendentes regulados por SOXN, que incluyen procesos celulares críticos como la diferenciación y la proliferación. Además, los compuestos que inhiben la enzima MEK interrumpen la vía ERK, una cascada de señalización en la que participa SOXN, por lo que es probable que disminuyan su actividad. Otros inhibidores dirigidos a la vía Wnt/β-catenina interfieren con los mecanismos de señalización que modulan la función de SOXN, lo que provoca una disminución de su actividad.
Otro grupo de inhibidores actúa sobre el ciclo celular y las vías de señalización relacionadas para modular la actividad de SOXN. Los inhibidores dirigidos a las quinasas dependientes de ciclinas pueden inhibir la progresión del ciclo celular, que es crucial para las funciones que desempeña SOXN en la diferenciación y proliferación celular. La inhibición de la vía del TGF-β también afecta indirectamente a la función de SOXN, dada su implicación en esta ruta de señalización. Las moléculas que inhiben la enzima γ-secretasa afectan a la señalización Notch, una vía en la que SOXN es activa, lo que conduce a una reducción de su actividad funcional. Además, los agentes que inhiben mTOR, CDK4/6 y la vía HIF también contribuyen a la inhibición indirecta de SOXN al influir en el crecimiento celular, la división y los procesos mediados por la hipoxia, respectivamente, que son todos procesos en los que se sabe que SOXN tiene un papel regulador.
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