SEL-10の化学的阻害剤は、標的タンパク質のユビキチン化とその後の分解を促進するタンパク質の能力を妨害することができる。例えばエモジンは、プロテアソーム酵素の活性を変化させることによってユビキチン-プロテアソーム経路を破壊し、通常は分解されるはずのタンパク質の蓄積をもたらす。この蓄積は間接的にSEL-10の機能を阻害する。同様に、クロロキンはリソソーム機能とオートファジーを障害することによって、SEL-10の役割に間接的に影響を与える。両過程は、SEL-10の標的を含む細胞成分の分解に関与しているからである。MG132、Lactacystin、Bortezomib、Carfilzomib、Ixazomib、Oprozomib、Epoxomicinなどのプロテアソーム阻害剤は、プロテアソームがユビキチン化された基質を分解するのを阻害することで、SEL-10の阻害に貢献している。SEL-10の基質が安定化するのは、これらの阻害剤が、通常これらのタンパク質のレベルを低下させるタンパク質分解活性を阻害するためである。
ウィザフェリンAやセラストロールのような他の化合物も、SEL-10がその一部である分解プロセスにとって重要なプロテアソーム活性を阻害することによって、同様の効果を発揮する。クルクミンもプロテアソームを阻害することが知られており、その結果、細胞内のSEL-10基質レベルが上昇する。この蓄積は、SEL-10がこれらのタンパク質を分解に向けるという正常な機能を果たせないことを示している。これらの化学的阻害剤に共通するのは、正常なユビキチン-プロテアソーム経路を混乱させ、SEL-10が通常ターンオーバーを助けるはずのタンパク質を安定化させ、SEL-10の機能的役割を間接的に阻害することである。
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