Os inibidores químicos da Scotina podem exercer os seus efeitos inibitórios através de vários mecanismos que induzem o stress do retículo endoplasmático (RE), levando a uma alteração da atividade da Scotina. A brefeldina A interrompe o transporte de vesículas através da inibição do fator de ribosilação do ADP, causando stress do RE e envolvendo a Scotina na apoptose em vez das suas funções reguladoras normais. Do mesmo modo, a tapsigargina e o ácido ciclopiazónico inibem a ATPase do Ca2+ do retículo sarcoplasmático/endoplasmático (SERCA), esgotando as reservas de cálcio do RE e induzindo o stress do RE, o que pode deslocar a atividade da Scotin das suas funções típicas para a manipulação de proteínas mal dobradas induzidas pelo stress. A tunicamicina bloqueia a glicosilação ligada à N, um processo necessário para a dobragem adequada das proteínas, o que pode causar a acumulação de proteínas mal dobradas no ER e, assim, prejudicar as funções habituais da Scotin, uma vez que esta se envolve em actividades de resposta proteica anormal.
Além disso, o Salubrinal e o Guanabenz, através da inibição selectiva da desfosforilação do eIF2α, aumentam a resposta às proteínas não dobradas, inibindo potencialmente a Scotin ao fixar a sua função na gestão das proteínas mal dobradas. O MG-132, como inibidor do proteassoma, provoca a acumulação de proteínas poliubiquitinadas, conduzindo a um stress do ER que pode desviar a função da Scotin para a manutenção da proteostase. A Eeyarestatin I inibe diretamente a degradação associada ao ER (ERAD), acumulando proteínas mal dobradas no ER e inibindo assim a Scotin, envolvendo-a em respostas de stress do ER. A ação da 2-Deoxi-D-glicose, que inibe a glicólise, pode também levar ao stress do RE através da depleção de energia, envolvendo a Scotina em respostas de stress. A azoramida, ao aumentar a capacidade de dobragem do ER, pode reduzir o envolvimento da Scotin na resposta às proteínas não dobradas, inibindo assim a sua atividade regular. A ISRIB, ao inverter os efeitos da fosforilação do eIF2α, e a GSK2606414, através da inibição da PERK, podem impedir o envolvimento da Scotin na resposta ao stress do ER, mantendo assim as suas funções celulares regulares, mas com um nível de atividade reduzido devido à ausência de sinalização de stress a que a Scotin responderia normalmente.
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