SAP30BP阻害剤は主に、ヒストン脱アセチル化酵素(HDAC)活性や他のエピジェネティックマーカーに影響を与える化合物を中心に展開されている。トリコスタチンA、SAHA、ロミデプシン、バルプロ酸、モセチノスタット、エンチノスタットはHDAC阻害剤である。これらの化学物質は、ヒストンのアセチル化状態の調節に重要な役割を果たし、その結果、クロマチンの構造とアクセシビリティに影響を与える。SAP30BPはSin3-HDAC複合体と関連しているので、これらの阻害剤はこの複合体、ひいてはSAP30BPの活性を調節することができる。
このクラスのもう一つの重要なサブセットは、BETブロモドメイン阻害剤、すなわちJQ1とI-BET151である。これらの化合物は、BETタンパク質とアセチル化ヒストンとの結合を阻害し、SAP30BPが影響を及ぼす転写制御やクロマチン構造に影響を及ぼす可能性がある。最後に、Chaetocin、UNC0638、BIX-01294、EPZ005687のようなヒストンメチルトランスフェラーゼ(HMT)を標的とする阻害剤も含まれる。これらの阻害剤はヒストンのメチル化状態を調節し、さらにクロマチンダイナミクスに影響を与え、SAP30BPが関与する経路や過程に影響を与える可能性がある。
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