Inhibiteurs RBM12

Les inhibiteurs courants de RBM12 comprennent, sans s'y limiter, Pladienolide B CAS 445493-23-2, Herboxidiene CAS 142861-00-5, Spliceostatin A CAS 391611-36-2, Isoginkgetin CAS 548-19-6 et Cdc2-Like Kinase Inhibitor, TG003 CAS 300801-52-9.

Les inhibiteurs de RBM12 sont une classe chimique conçue pour cibler la protéine 12 à motif de liaison à l'ARN (RBM12), qui fait partie d'un groupe plus large de protéines de liaison à l'ARN. La RBM12 joue un rôle dans la régulation de l'épissage et du traitement de l'ARN, qui sont des composants essentiels de l'expression génétique. La protéine contient des domaines qui sont spécifiquement impliqués dans la liaison à l'ARN, et elle peut interagir avec d'autres protéines et molécules d'ARN pour former des complexes essentiels à divers processus métaboliques de l'ARN. En inhibant RBM12, ces composés interfèrent avec la capacité de la protéine à se lier à l'ARN, ce qui peut affecter l'épissage et le traitement des ARNm précurseurs. Le mécanisme exact par lequel les inhibiteurs de RBM12 exercent leur effet peut varier; certains peuvent bloquer directement le site de liaison à l'ARN, tandis que d'autres peuvent induire des changements de conformation qui modifient la structure secondaire ou tertiaire de la protéine, ce qui a un impact sur son interaction avec l'ARN.

La découverte et le développement d'inhibiteurs de RBM12 impliquent une combinaison de criblage à haut débit, d'analyse de la relation structure-activité (SAR) et de modélisation moléculaire. Dans un premier temps, des composés inhibiteurs potentiels peuvent être identifiés grâce à un criblage à grande échelle de chimiothèques afin de trouver des molécules capables de moduler l'activité de la RBM12. Ces composés sont ensuite soumis à une batterie d'essais biochimiques et biophysiques pour caractériser leur affinité de liaison, leur spécificité et leur puissance inhibitrice vis-à-vis de RBM12. La spécificité étant un facteur critique, compte tenu de la vaste famille de protéines liant l'ARN et possédant des domaines de liaison similaires, des efforts considérables sont déployés pour s'assurer que les inhibiteurs candidats sont sélectifs pour RBM12, minimisant ainsi les effets hors cible. Les chercheurs peuvent utiliser des techniques telles que la cristallographie aux rayons X, la spectroscopie de résonance magnétique nucléaire (RMN) ou la cryo-microscopie électronique pour résoudre la structure de RBM12, à la fois seul et en complexe avec l'inhibiteur.