PXKの化学的阻害剤は、PXKが関連する様々なシグナル伝達経路や酵素活性を阻害することによって機能する。StaurosporineとBisindolylmaleimideは、PXKが相互作用することが知られているタンパク質キナーゼを標的として作用する。Staurosporineは、シグナル伝達経路におけるPXKの機能に不可欠なキナーゼ活性を阻害する幅広いキナーゼ阻害剤である。同様に、BisindolylmaleimideはプロテインキナーゼC(PKC)を特異的に阻害し、PXKはそのPXドメインを利用してPKCと相互作用するので、この相互作用は細胞内でシグナルを伝達するPXKの役割に必須である。PI3K阻害剤LY294002とWortmanninはPI3K経路を阻害するが、これはPXKの細胞内シグナル伝達への関与にとって極めて重要である。PI3Kの阻害は、最終的にPXKの機能を破壊するカスケード効果をもたらす。PP2とダサチニブは、それぞれSrcファミリーチロシンキナーゼと、より広範なチロシンキナーゼを阻害し、PXKがシグナル伝達経路内で機能するために必要なリン酸化事象を阻止する。
さらに、U0126、SP600125、SB203580は、MEK、JNK、p38 MAPKなどのMAPK経路の様々な構成要素を阻害する。PXKとMAPK経路との相互作用は、これらのキナーゼの阻害がシグナル伝達の低下、ひいてはPXK活性の低下につながることを意味する。Gタンパク質のGsαサブユニットを標的とするNF449は、PXKが属するGタンパク質共役シグナル伝達経路を破壊し、これらの経路におけるPXKの役割の阻害につながる。もう一つのPKC阻害剤であるGo6983は、Bisindolylmaleimideと同様に、PXKとPKCの相互作用を確実に阻害し、シグナル伝達におけるPXKの機能に不可欠である。最後に、Y-27632はアクチン細胞骨格構成に影響を与えるROCKキナーゼを阻害する。PXKは細胞骨格の動態に関与しているので、Y-27632によるROCKキナーゼの阻害は、PXKが関与するシグナル伝達経路の崩壊につながり、細胞プロセスにおける機能的役割を阻害する可能性がある。
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