Os inibidores químicos da PREP-2 actuam principalmente através da perturbação do estado de fosforilação da proteína, que é uma modificação crítica para a sua atividade. Compostos como a Bisindolilmaleimida I, Ro-31-8220, Go 6983, LY333531, Gö 6976, Ruboxistaurina, Sotrastaurina, Enzastaurina, Queleritrina, Hispidina, Estaurosporina e Balanol foram identificados como inibidores da proteína quinase C (PKC), que desempenha um papel fundamental na fosforilação da PREP-2. Por exemplo, a Bisindolilmaleimida I e o Ro-31-8220 são inibidores específicos da PKC e, ao inibirem a PKC, impedem a fosforilação da PREP-2, que é um pré-requisito para a sua ativação. O Go 6983, um inibidor pan-PKC, e o LY333531, um inibidor seletivo das isoformas beta da PKC, funcionam ambos para bloquear a atividade cinase que normalmente fosforilaria o PREP-2, levando assim à sua inibição funcional.
Para além dos mecanismos de inibição, o Gö 6976 visa as isoformas de PKC dependentes do cálcio, impedindo assim a fosforilação e a subsequente ativação do PREP-2. A enzastaurina, ao inibir seletivamente a PKC beta, reduz a regulação dependente da fosforilação da PREP-2, inibindo eficazmente a sua função. A sotrastaurina, com a sua atividade inibidora da PKC de largo espetro, também contribui para a inibição da PREP-2, bloqueando a atividade da quinase necessária para a sua ativação. A queleritrina e a hispidina, com a sua potente inibição da PKC, impedem os eventos de fosforilação necessários para a atividade do PREP-2. A estaurosporina, um inibidor não seletivo da proteína cinase, interrompe a atividade cinase mais ampla que contribuiria para a ativação do PREP-2. Por último, o Balanol actua como um inibidor competitivo da PKC, bloqueando o local de ligação da quinase ao ATP e inibindo assim a atividade da quinase essencial para a fosforilação do PREP-2 e subsequente função. Cada um destes produtos químicos, através da sua inibição específica da PKC, assegura que os mecanismos dependentes da fosforilação necessários para a atividade do PREP-2 são interrompidos, levando à inibição funcional do PREP-2.
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