PREP-2の化学的阻害剤は、活性に重要な修飾であるタンパク質のリン酸化状態を阻害することによって作用する。BisindolylmaleimideI、Ro-31-8220、Go 6983、LY333531、Gö 6976、Ruboxistaurin、Sotrastaurin、Enzastaurin、Chelerythrine、Hispidin、Staurosporine、Balanolなどの化合物は、PREP-2のリン酸化に重要な役割を果たすプロテインキナーゼC(PKC)の阻害剤として同定されている。例えば、Bisindolylmaleimide IとRo-31-8220は、PKCの特異的阻害剤であり、PKCを阻害することにより、PREP-2の活性化の前提条件であるリン酸化を阻止する。汎PKC阻害剤であるGo 6983と、PKCβアイソフォームの選択的阻害剤であるLY333531は、ともに通常PREP-2をリン酸化するキナーゼ活性を阻害し、PREP-2の機能阻害をもたらす。
さらに、Gö 6976は、カルシウム依存性のPKCアイソフォームを標的として、PREP-2のリン酸化とそれに続く活性化を阻害する。Enzastaurinは、PKCβを選択的に阻害することにより、PREP-2のリン酸化依存的な制御を減少させ、その機能を効果的に阻害する。幅広いPKC阻害活性を持つソトラスタウリンも、PREP-2の活性化に必要なキナーゼ活性を阻害することにより、PREP-2の阻害に寄与する。PKCを強力に阻害するChelerythrineとHispidinは、PREP-2の活性化に必要なリン酸化を阻害する。非選択的プロテインキナーゼ阻害剤であるスタウロスポリンは、PREP-2の活性化に寄与するであろう広範なキナーゼ活性を阻害する。最後に、BalanolはPKCのATP競合的阻害剤として作用し、キナーゼのATP結合部位をブロックすることで、PREP-2のリン酸化とそれに続く機能に不可欠なキナーゼ活性を阻害する。これらの化学物質はそれぞれ、PKCを標的として阻害することにより、PREP-2の活性に必要なリン酸化依存性の機構を確実に破壊し、PREP-2の機能阻害に導く。
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