Inhibiteurs PQBP-1

Les inhibiteurs courants de la PQBP-1 comprennent, sans s'y limiter, l'inhibiteur de l'agrégation de polyglutamine, PGL-135 CAS 26278-83-1, l'actinomycine D CAS 50-76-0, la trichostatine A CAS 58880-19-6, l'α-Amanitine CAS 23109-05-9 et le cycloheximide CAS 66-81-9.

Les inhibiteurs de PQBP-1 représentent une classe de molécules qui interagissent spécifiquement avec la protéine 1 de liaison à la polyglutamine (PQBP-1), une protéine nucléaire qui joue un rôle crucial dans la régulation de la transcription, l'épissage de l'ARN et le remodelage de la chromatine. La PQBP-1 est connue pour se lier aux polyglutamines, qui sont des séquences de résidus de glutamine dans les protéines, typiquement étendues dans certaines protéines associées à des conditions neurodégénératives. L'interaction moléculaire entre PQBP-1 et ses ligands est essentielle pour comprendre les réseaux de régulation dans le noyau, en particulier ceux associés à l'organisation dynamique de la chromatine et au contrôle ultérieur de l'expression des gènes. Les inhibiteurs de PQBP-1 sont conçus pour perturber ces interactions protéine-protéine spécifiques, modifiant ainsi les effets en aval sur la régulation des gènes et le traitement de l'ARN.

La diversité structurelle des inhibiteurs de PQBP-1 découle de la nécessité de se lier sélectivement au domaine de liaison de la polyglutamine de PQBP-1 sans affecter d'autres domaines ou protéines au sein de la cellule. Ces inhibiteurs présentent souvent des architectures moléculaires complexes, conçues pour atteindre une spécificité et une affinité élevées pour la PQBP-1. Des études structurales ont montré que ces inhibiteurs peuvent imiter les ligands naturels de la PQBP-1 ou, au contraire, occuper le site de liaison d'une manière qui empêche l'association de la PQBP-1 avec ses substrats naturels. La conception des inhibiteurs de la PQBP-1 tient également compte de la stabilité du complexe inhibiteur-protéine, du potentiel de modulation allostérique et des implications pour la localisation nucléaire. En modulant l'activité de la PQBP-1, ces inhibiteurs fournissent des informations précieuses sur la fonction de la protéine et son rôle plus large dans la machinerie cellulaire, y compris son implication dans la régulation transcriptionnelle et la modulation de la structure de la chromatine.