エピガロカテキンガレート(EGCG)は、様々なタンパク質のリン酸化状態を調節することが知られており、細胞内シグナル伝達に影響を与えることで、RNAポリメラーゼIIIの活性に影響を与える可能性がある。フォルスコリンもまた、アデニルシクラーゼを活性化することで細胞内のcAMPレベルを上昇させ、cAMP依存性プロテインキナーゼ(PKA)シグナル伝達経路を通じてRNAポリメラーゼIIIの機能を高める可能性のある薬剤である。カルシウムイオノフォアであるイオノマイシンは、細胞内カルシウムレベルを上昇させ、カルシウム依存性のシグナル伝達カスケードを活性化し、間接的にPOLR3Kに影響を与える可能性がある。PMAは、転写因子や他のタンパク質のリン酸化に関与するプロテインキナーゼC(PKC)を活性化し、それによってRNAポリメラーゼIII活性を調節する。このことは、POLR3Kの活性がPKC経路の影響を受けている可能性を示唆している。SB 216763のような化合物はグリコーゲン合成酵素キナーゼ-3(GSK-3)を阻害することから、タンパク質合成が促進され、間接的にPOLR3K活性が上昇する可能性がある。
LY 294002のようなPI3K阻害剤は、転写活性を調節しうる下流のシグナル伝達経路を破壊し、POLR3Kに影響を与える可能性がある。MEK阻害剤であるPD 98059もまた、遺伝子の転写を調節するシグナル伝達カスケードを変化させ、それによってPOLR3K活性に影響を及ぼす可能性がある。同様に、mTOR阻害剤であるラパマイシンは細胞増殖シグナルに変化をもたらし、間接的にPOLR3K活性に影響を及ぼす可能性がある。Wortmanninは、LY 294002と同様にPI3K阻害剤であり、細胞増殖と転写シグナル伝達に影響を与え、POLR3Kに影響を与える可能性がある。MEK1/2の選択的阻害剤であるU0126は、転写因子の制御に影響を与え、やはりPOLR3Kに影響を与える可能性がある。ヒストン脱アセチル化酵素阻害剤であるトリコスタチンAやDNAメチル化酵素阻害剤である5-アザシチジンなどのエピジェネティック修飾剤は、それぞれクロマチン構造とDNAメチル化パターンを変化させ、POLR3Kが活動する転写ランドスケープに影響を与える可能性がある。
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